计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 596|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] 求助CH3CH3分子F取代产物与OH自由基反应速率与mayer键级关系的问题

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

149

eV
积分
152

Level 3 能力者

老师,我想问一下。我做的是CH3CH3分子F取代产物与OH自由基反应速率的分析。优化用的是# B3LYP/6-31G* ,计算反应速率用的是# M062x/def2tzvp

CHF2CHF2反应速率1.2754*10*-14 molecules-1 cm3 s-1.mayer 键级0.5476
CHF2CF3反应速率6.03*10* -16molecules-1 cm3 s-1mayer 键级0.5345
为何CHF2CF3反应速率更小。mayer键级也小呢。一般而言,反应速率越小,相应的mayer键级应该更大才对。非常感谢



202311091504264866..png (787 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 10)

202311091504264866..png

202311091500383207..png (6 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

202311091500383207..png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-11-9 17:11:55 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “mayer键级计算” 改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-11-9 17:48:25 | 只看该作者 Only view this author
自觉把问题描述清楚,算的是什么反应、Mayer键级是对什么算的

仔细看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

149

eV
积分
152

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-9 18:54:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yyyyyyzzz 于 2023-11-9 19:17 编辑
sobereva 发表于 2023-11-9 17:48
自觉把问题描述清楚,算的是什么反应、Mayer键级是对什么算的

仔细看

计算的是CH3CH3分子F取代产物与OH自由基的抽氢反应。用 B3LYP / 6-31G*泛函,对各个反应物、产物和过渡态进行了结构优化,成功找到过渡态的唯一振动虚频, 并用 IRC 方法对反应物和产物进行确认. 对于反应中的能量变化, 全部进行了零点能的校正.用M0-62x/def2tzvp泛函对各个反应物、产物和过渡态进行能量计算。用shermo程序计算过渡态和反应物的吉布斯自由能以此计算抽氢反应的反应势垒。据基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格http://sobereva.com/soft/TSTcalculator.xlsx计算抽氢反应的反应速率。用Multiwfn计算被抽取的H原子C-H键之间的mayer键级。
得到的结果如下:
CHF2CHF2          反应速率   1.24357E-14molecules-1·cm3·s-1       mayer键级(C-H)  0.54981415a.u.
CHF2CF3        反应速率     6.03189E-16molecules-1·cm3·s-1         mayer键级(C-H) 0.52593472a.u.
不符合反应速率越小,mayer键级应该越大的规律。
谢谢老师。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2023-11-10 07:32:10 | 只看该作者 Only view this author
yyyyyyzzz 发表于 2023-11-9 18:54
计算的是CH3CH3分子F取代产物与OH自由基的抽氢反应。用 B3LYP / 6-31G*泛函,对各个反应物、产物和过渡态 ...

用电子能垒去对比,省得牵扯到热力学校正量、隧道效应这些额外的因素

如果电子能垒也是和键级顺序反着,用《Multiwfn支持的分析化学键的方法一览》(http://sobereva.com/471)里说的拉普拉斯键级再试,和键强度的关系明显好于Mayer键级。如果还和期望不符,算一下C-H键键能,看是否能解释
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

149

eV
积分
152

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-10 12:56:20 | 只看该作者 Only view this author
好的、谢谢老师解答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 09:31 , Processed in 0.221442 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list