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[综合讨论] 请问怎么看确定药剂与团簇是否发生了氢键吸附?

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各位老师、同学们好,我在做一个阳离子在矿物表面的吸附,吸附能为-33.34Kcal/mol,请问怎么看确定药剂与团簇是否发生了氢键吸附?
下面是我的工作流程:对钾长石(010)能量最低的面切晶面建立真空层,用castep进行几何预优化,然后超晶胞挖出团簇(保证团簇模型的化学计量比),使用dmol3对团簇进行几何优化(固定底层),将已优化的药剂分子放在团簇上,进行吸附,完成后计算吸附能。


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发表于 Post on 2023-11-10 14:51:31 | 只看该作者 Only view this author
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html

IGMH非常清楚直观。而且支持周期性体系。用于周期性体系计算过程也可以参考下文(下文是NCI和IGM方法,IGMH和IGM的用法非常类似)
使用Multiwfn结合CP2K通过NCI和IGM方法图形化考察固体和表面的弱相互作用
http://sobereva.com/588http://bbs.keinsci.com/thread-21742-1-1.html


更多信息见
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表!
http://sobereva.com/667http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html

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