关于使用shermo软件优化能量时出现的闪退错误的求助

xiaowoniu1992 · 发表于 Post on 2023-11-30 17:27:32

使用高斯软件、M062X\6-311+g（d,p）计算一个结构，该结构前两项收敛，但后两项不收敛，但做计算的同学说这个结构绝对可用，出现这种情况的原因是势能面比较平滑。但该输出文件拖入shermo后回车就闪退。具体输出的结构如下图。出于我的化学认知，在两个氧中间有一个氢形成氢键的话，体系的能量能进一步降低。由于不知道哪个氢比较合适形成氢键，因此开始在输入文件中并未将氢画在氧原子中间。我的问题是这个输出文件合理吗？如果合理，将其拖入shermo后回车闪退的问题该如何解决？输出文件如下网盘，感谢各位老师的指教！

链接: https://pan.baidu.com/s/10_-XKkjqu2vhgWdgg0Y7zg?pwd=m6mw 提取码: m6mw

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-1 05:44:13

先确保做了振动分析、振动分析正常做完了
那么点输出文件压缩后直接上传，别弄到百毒网盘，下载还麻烦

xiaowoniu1992 · 发表于 Post on 2023-12-1 18:24:14

本帖最后由 xiaowoniu1992 于 2023-12-2 17:16 编辑

卢老师，昨天我再次向帮忙做计算的同学请求确认，他联系我说当时发给我的输出文件发错了。现在使用正确的文件shermo已经可以正常算出热力学数据结果了。不过后两项不收敛的情况仍然存在，以及能量最低时的结构不存在分子内氢键，这样的输出结构合理吗？我在画初始结构时候由于不确定哪个氢更适合形成氢键，所以画初始结构将两个氢都尽量远离，想通过gaussian计算自动定位氢键的位置，显而易见未能实现。输出文件已压缩后上传。@sobereva

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-2 11:15:22

xiaowoniu1992 发表于 2023-12-1 18:24
卢老师，昨天我再次向帮忙做计算的同学请求确认，他今天联系我说当时发给我的输出文件发错了。现在使用正确 ...

看
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278（http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html）

初猜结构摆得不合适，旋转羟基后重新优化

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[新手求助] 关于使用shermo软件优化能量时出现的闪退错误的求助

评分 Rate