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[Gaussian/gview] 频率分析断掉,找到rwf文件,如何知道xx.rwf对应哪个任务?

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楼主
求问,LZ用服务器计算频率分析,断掉,之后在scratch文件夹中找到rwf文件,但在该文件下有很多rwf文件,求问如何找到我任务的rwf文件?rwf文件名是否有具体含义?

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发表于 Post on 2016-9-29 21:32:27 | 只看该作者 Only view this author
打开.out文件,第4-6行应该为下列内容:
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -scrdir=/root/
Entering Link 1 = /home/ren/g09/l1.exe PID=       950.
rwf文件应该为“Gau-950.rwf”,rwf文件名中的数字应该与PID的数字对应。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-29 21:43:11 | 只看该作者 Only view this author
believeht 发表于 2016-9-29 21:32
打开.out文件,第4-6行应该为下列内容:
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -s ...

非常感谢您,已解决。感恩~~

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发表于 Post on 2016-9-30 08:52:10 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主,你是要进行频率的续算吗?是的话续算的关键词是什么呢?因为太耗时所以经常出现在指定时间内算不完的情况
If anything is impossible? It should be done!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 09:05:19 | 只看该作者 Only view this author
三石草祭 发表于 2016-9-30 08:52
请问楼主,你是要进行频率的续算吗?是的话续算的关键词是什么呢?因为太耗时所以经常出现在指定时间内算不 ...

gjf文件内容:
%rwf=1.rwf
%nosave
%chk=1.chk
# restart

restart之后空两行,再无其他内容。
注释:1为任务名字,将rwf文件,gjf文件(如果用服务器,还有脚本文件)放到同一个目录下,提交任务即可。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 09:09:29 | 只看该作者 Only view this author
believeht 发表于 2016-9-29 21:32
打开.out文件,第4-6行应该为下列内容:
Initial command:
/home/ren/g09/l1.exe /root/Gau-949.inp -s ...

请问在任务提交后,运行了10小时候依然是如下情况,何解?
******************************************
Gaussian 09:  EM64L-G09RevA.01  8-May-2009
                29-Sep-2016
******************************************
%rwf=abc.rwf
%nosave
%chk=abc.chk
---------
# restart
---------
(Restarting at link 1002)
ILRest=         101.
          IDoAtm=11111111111111111111111111111111111111111111111111
          IDoAtm=1111111111111111111111111111
          Differentiating once with respect to electric field.
                with respect to dipole field.
          Differentiating once with respect to nuclear coordinates.
          There are   237 degrees of freedom in the 1st order CPHF.  IDoFFX=5.
    237 vectors produced by pass  0 Test12= 1.28D-13 1.00D-09 XBig12= 2.43D+03 2.93D+01.
AX will form    27 AO Fock derivatives at one time.

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发表于 Post on 2016-9-30 11:18:18 | 只看该作者 Only view this author
Aristotler 发表于 2016-9-30 09:05
gjf文件内容:
%rwf=1.rwf
%nosave

谢谢,我尝试一下
If anything is impossible? It should be done!!

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发表于 Post on 2016-9-30 11:50:01 | 只看该作者 Only view this author
Aristotler 发表于 2016-9-30 09:09
请问在任务提交后,运行了10小时候依然是如下情况,何解?
***************************************** ...

如果明显超过理应的计算耗时,就停了重算
如果没超,继续等
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 14:22:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-30 11:50
如果明显超过理应的计算耗时,就停了重算
如果没超,继续等

感谢大神回复,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-30 16:10:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-30 11:50
如果明显超过理应的计算耗时,就停了重算
如果没超,继续等

大神,本人算的分子是卟啉,78个原子,之前在天河上运行过2天(用户限制)掉下来了,用到您说的续点地方法,在服务器上继续分析,得到如上情况。现在的时间也是17个小时了。这样的情况超过了理应的计算耗时吗?(b3lyp 6-31g(d) )请问重算是不是还会这样?

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发表于 Post on 2016-9-30 17:18:03 | 只看该作者 Only view this author
Aristotler 发表于 2016-9-30 16:10
大神,本人算的分子是卟啉,78个原子,之前在天河上运行过2天(用户限制)掉下来了,用到您说的续点地方 ...

天河没用过。
你最好重新算一次,写上#P以便监控输出,省得卡住也不知道什么情况
这种体系这种级别算freq不至于特别耗时
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-2 15:34:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-9-30 17:18
天河没用过。
你最好重新算一次,写上#P以便监控输出,省得卡住也不知道什么情况
这种体系这种级别算fr ...

好的,大神,我尝试一下,感谢您

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