计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 585|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 寻找醇胺溶液吸收二氧化碳过渡态时报错内存不够

[复制链接 Copy URL]

3

帖子

0

威望

19

eV
积分
22

Level 1 能力者

本帖最后由 mmmoment 于 2024-1-19 13:41 编辑

老师们好,我想做的是找到MEA(乙醇胺HO-CH2-CH2-NH2)与CO2反应的过渡态氨基甲酸根(MEAH+COO-),这是一个不稳定的两性离子,反应物都是优化过的,第一张图是我构建的过渡态,第二张图是文献中找到的过渡态,第三是输入文件,第四张图是输出文件。我的体系不算大,内存应该够用,是输入文件的问题导致报错内存不够吗? 我之前学习软件的时候也遇到小分子体系提示内存不够,仔细检查发现是构建分子时原子选错了,但这次仔细检查很多遍又重新画了很多遍都没找到原因。另外文献提到反应模拟在一定大小的立方盒中进行,控制MEA分子、CO2分子和水分子个数比例来模拟溶液浓度,这是怎么实现的呢,有相关参考资料吗(昨天中午第一次在qq群提问贴了太多长图,已经认识到错误了,非常抱歉,再也不会了






1.jpg (34.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

图一 我构建的过渡态

图一 我构建的过渡态

2.jpg (67.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

图二 文献中找到的过渡态

图二 文献中找到的过渡态

3.jpg (213.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

图三 输入文件

图三 输入文件

4.jpg (25.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

图四 输出文件

图四 输出文件

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-1-19 20:09:11 | 只看该作者 Only view this author
跟内存没关系
chk文件路径里不要出现问号之类字符以及空格,显然自找麻烦
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1万

帖子

0

威望

7398

eV
积分
18160

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2024-1-19 20:45:04 | 只看该作者 Only view this author
输出文件最后一行是内存,不代表内存不够用。可能是程序在输出内存信息以后发现了另外的一个问题,但还没来得及输出报错信息,程序就死掉了,或者报错信息输出到stderr了。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

3

帖子

0

威望

19

eV
积分
22

Level 1 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-19 21:53:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-19 20:45
输出文件最后一行是内存,不代表内存不够用。可能是程序在输出内存信息以后发现了另外的一个问题,但还没来 ...

非常感谢老师们,长记性了!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 13:37 , Processed in 0.225545 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list