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[Multiwfn使用咨询] aNCl分析教程有不懂之处,纯小白求助大神

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本帖最后由 艾尔斯灿 于 2024-1-21 15:34 编辑

使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)
这个是教程的链接
纯小白,0接触,实在是没看懂
按步骤生成.xyz文件.可是为什么我的.xyz文件原子数只有160,.而给的示例文件原子数有161
Multiwfn中,正常的示例文件的是 H72 C53 N16 O18 S2      而我的是 H72 C52 N16 O18 S2    少了一个C




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2#
发表于 Post on 2024-1-20 22:30:37 | 只看该作者 Only view this author
没有叫“多功能波函数”的东西,别给Multiwfn乱起名

这都是GROMACS、VMD基本使用常识,跟Multiwfn无关。删除仅有的一帧当然之后还得往同一个ID里载入轨迹,北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)里我都明确讲过



注意语言表达清楚,“可是为什么我的.xyz文件只有160,180行.而给的示例文件有161,而且有16万行” 都不知道你说的160、180、161是什么东西

搞清楚xyz文件格式定义
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobereva.com/477

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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