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[GROMACS] bash文件跑结合能时报错:显示cannot open file `_pid.pdb'

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楼主
通过网上教程修改了bash文件,运行命令:bash gmx_mmpbsa.bsh报错
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>

>> 0. set up environmets and parameters: OK !

>> 1. pre-processe trajectory: OK !

>> 2. generate qrv file: OK !

>> 3. run MM-PBSA calculatons
awk: fatal: cannot open file `_pid.pdb' for reading (没有那个文件或目录)
awk: cmd. line:56: fatal: cannot open file `_pid.pdb' for reading (没有那个文件或目录)
<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
请问是哪里的问题?该如何解决?谢谢大家

结尾附上修改后的bash文件

gmx_mmpbsa.bsh

29.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

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2#
发表于 Post on 2024-4-24 17:21:57 | 只看该作者 Only view this author
你好,请问问题解决了吗?

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