计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 550|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] VMD显示颜色不同设备有差异如何统一呢,求助

[复制链接 Copy URL]

47

帖子

0

威望

223

eV
积分
270

Level 3 能力者

这是A设备的VMD显示颜色



这是这是B设备的VMD显示颜色


不知道为什么,B设备的VMD等都是新安装的,其中部分两设备颜色不同,例如上图中环中间的颜色,或者一些蓝色和绿色.

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-2-1 11:57:56 | 只看该作者 Only view this author
检查操作过程的一致性、isovalue的设置
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

47

帖子

0

威望

223

eV
积分
270

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 15:19:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-1 11:57
检查操作过程的一致性、isovalue的设置

确认操作过程一致,isovalue设置相同,唯一的区别在Trajectory中的Color Scale Data Frame下的数值,可是我们统一数值后发现颜色仍不一样,猜测是因为A设备为1.9版本的VMD,B设备为1.9.3的VMD,求助真实原因和解决办法

47

帖子

0

威望

223

eV
积分
270

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 16:13:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-1 11:57
检查操作过程的一致性、isovalue的设置

http://sobereva.com/591
安装教程是设置,发现和教程中图像颜色也不一样,不确定原因,求助

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2024-2-2 01:53:48 | 只看该作者 Only view this author
艾尔斯灿 发表于 2024-2-1 15:19
确认操作过程一致,isovalue设置相同,唯一的区别在Trajectory中的Color Scale Data Frame下的数值,可是我 ...

显然先把能统一的尽可能统一,没任何理由用不同版本
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

47

帖子

0

威望

223

eV
积分
270

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-2 08:32:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 艾尔斯灿 于 2024-2-2 09:15 编辑
sobereva 发表于 2024-2-2 01:53
显然先把能统一的尽可能统一,没任何理由用不同版本

我现在很需要知道颜色差异的原因,我确认了是B设备的问题,和VMD版本无关,我们尝试过了,没办法把颜色全统一,其他地方也不知道该怎么调整.现在色差问题已经阻碍我们现在的研究成果,求助.

213

帖子

1

威望

2232

eV
积分
2465

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2024-2-2 10:21:14 | 只看该作者 Only view this author
艾尔斯灿 发表于 2024-2-2 08:32
我现在很需要知道颜色差异的原因,我确认了是B设备的问题,和VMD版本无关,我们尝试过了,没办法把颜色全统一 ...

在一台电脑上作图行不?
比如,把b电脑的vmd 存一个snapshot ,在a电脑上打开,做图。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2024-2-3 05:05:18 | 只看该作者 Only view this author
艾尔斯灿 发表于 2024-2-2 08:32
我现在很需要知道颜色差异的原因,我确认了是B设备的问题,和VMD版本无关,我们尝试过了,没办法把颜色全统一 ...

如果你咬定是机子问题,换其它机子就完了。没其它机子还可以用虚拟机
这种事不在现场根本说不清楚
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

47

帖子

0

威望

223

eV
积分
270

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-3 13:35:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-3 05:05
如果你咬定是机子问题,换其它机子就完了。没其它机子还可以用虚拟机
这种事不在现场根本说不清楚

谢谢社长,找到问题了,是其他人给我的avgRDG.vmd文件是把avgRDG_TFI.vmd改了名给我的.

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 05:28 , Processed in 0.181784 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list