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[新手求助] 求助C,H,O,N,S,Ti组成总数为223个原子的分子优化位移难以收敛的问题

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各位老师好,最近在优化一个分子,原子由C,H,O,N,S,Ti组成,总数为223个,使用软件为Gaussian 09, Revision C.01。优化过程受力和位移一直震荡,前后调了近两个星期,目前输入文件如图一,优化的模型如图二,但是位移依旧震荡,感觉没有向好的趋势。目前算的特别慢,而且由于返稿期限的问题时间比较紧,优化完后还要算电荷转移和投影态密度,请问还有什么办法可以尝试?

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发表于 Post on 2024-2-19 13:22:58 | 只看该作者 Only view this author
带有Ti用M06-2X合适吗……?你这可能都不是震荡的问题

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发表于 Post on 2024-2-19 13:23:24 | 只看该作者 Only view this author
大体系几何优化步数更多,这才30~40步,而且你这体系弱相互作用显著,优化没结束很正常。
限于用Gaussian的话,(1)加核心;(2)多给内存,24核机子不可能就10G内存;(3)适当减小模型大小;(4)使用混合基组;(5)用低级别的方法(如半经验等)先做一次优化,然后再用高级别的方法优化。不建议在几何优化不接近收敛时把maxstep设小,优化步骤很可能更多。
不限于用Gaussian的话,可以考虑用ORCA开RI计算,泛函、基组完全一致时算一次能量的时间只有Gaussian的几分之一。ORCA优化好的结构可以换用Gaussian做后续计算。有时间或者担心的话换用在用Gaussian优化一遍。

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发表于 Post on 2024-2-19 14:14:34 | 只看该作者 Only view this author
找个更好的机子算,没有就去租

本来M06-2X就严重不适合这种体系,而且速度还慢,由于对积分格点敏感,几何优化往往还更难收敛、更容易出现虚频,用这个完全是自找麻烦。改成PBE0-D3(BJ),结合int=fine,几何优化每步速度快能一倍甚至更多。maxstep没必要那么小。没事别随便用M06-2X做几何优化。

当前用的什么基组也没明确说,别人也没法准确回答怎么从基组层面改进。这种事都必须自觉交代清楚

此外,明显能量、受力都还有平滑收敛趋势,甭那么着急。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 20:39:59 | 只看该作者 Only view this author
Strange 发表于 2024-2-19 13:22
带有Ti用M06-2X合适吗……?你这可能都不是震荡的问题

感谢感谢,因为考虑弱相互作用所以用的m062x,Ti用赝势基组算的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 20:40:36 | 只看该作者 Only view this author
ahxb 发表于 2024-2-19 13:23
大体系几何优化步数更多,这才30~40步,而且你这体系弱相互作用显著,优化没结束很正常。
限于用Gaussian ...

感谢,感谢,我重新改一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 20:48:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-19 14:14
找个更好的机子算,没有就去租

本来M06-2X就严重不适合这种体系,而且速度还慢,由于对积分格点敏感,几 ...

好的好的,感谢老师,我找一个能用D3(BJ)的机子。基组主族元素的原子用的6-31g(d),Ti用的LANL2DZ。请问老师maxstep设几合适呢? 5可以吗?

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发表于 Post on 2024-2-19 20:56:24 | 只看该作者 Only view this author
学物理不秃头 发表于 2024-2-19 20:48
好的好的,感谢老师,我找一个能用D3(BJ)的机子。基组主族元素的原子用的6-31g(d),Ti用的LANL2DZ。请问 ...

除非你之前确实发现震荡了,否则没必要设这个。没准可能原本较少的步数就能达到极小点结构,加了这个反倒需要多几十步白浪费很多时间
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 21:00:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-19 20:56
除非你之前确实发现震荡了,否则没必要设这个。没准可能原本较少的步数就能达到极小点结构,加了这个反倒 ...

好的老师,感谢您。那我先跑一段时间观望一下。

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