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[新手求助] 中性分子反应产生正负离子中间体的反应如何计算比较合理?

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请问一下各位老师,我想计算图中这样一个酸催化反应机理,但是比如第一步反应涉及酸给出质子产生碳正离子和酸根负离子,这个过程自由能增加了40kcal左右,感觉太大了,不是很合理(第二步TS1活化能20kcal左右)。想来应该来源于我假设了反应后酸根与碳正相距了无穷远,但如果我把他们放在一起优化,他们又总是倾向于成键,而不利于后续反应。实际上第一步并不是我想研究的主要过程(而是第二步),不太希望在这方面细节揪得太深,请问是否有什么简化但又还算合理的方法呢?任何回复都十分感谢!

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发表于 Post on 2024-3-12 18:19:16 | 只看该作者 Only view this author
一种可能是第二分子酸参与反应,形成[TsO-H-OTs]-负离子,相比TsO-更不倾向于与碳成键。
另一种可能是OTs本来就待在碳上,第二分子噻吩接近以后,OTs才解离

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BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 18:37:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-3-12 18:19
一种可能是第二分子酸参与反应,形成[TsO-H-OTs]-负离子,相比TsO-更不倾向于与碳成键。
另一种可能是OTs ...

非常感谢您的回复!根据文献中经过优化后的条件,底物和酸都是一当量的,所以似乎第二种可能更合理?若是这样,依您看TsO-结合在哪个碳上比较合理呢?是失去OH的那个吗?

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发表于 Post on 2024-3-12 18:48:29 | 只看该作者 Only view this author
Sunlight22 发表于 2024-3-12 11:37
非常感谢您的回复!根据文献中经过优化后的条件,底物和酸都是一当量的,所以似乎第二种可能更合理?若是 ...

酸是催化剂,在这个反应里不消耗,所以即使酸投了一当量,反应也可能是两分子的酸活化一分子的底物。
你优化碳正离子和OTs发现成键,OTs和哪个碳成的键,就应该结合在哪里
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 18:57:07 | 只看该作者 Only view this author
感谢您的建议,我再做尝试!

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