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[Multiwfn使用咨询] 绘制AIM图时,想查询某个临界点的值求助

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本帖最后由 七尺贱 于 2024-3-18 21:02 编辑

各位老师好,我在利用Multiwfn绘制AIM图时,想查询某个临界点的值,我点击这个原子,vmd显示index: 34079,可CPprop.txt压根没有这么多值。AIM具体操作是AIM.txt文件。将文件放入了网盘,希望各位老师指点一下
链接:https://pan.baidu.com/s/1CrD--QDwa4AHYQB87V0PdA
提取码:9ncp
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mol.pdb


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AIM.txt

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发表于 Post on 2024-3-18 20:49:11 | 只看该作者 Only view this author
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-18 21:01:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445(ht ...

老师还是有问题,我是这样操作的
2  //拓扑分析
2  //以每个原子核为初猜搜索临界点
3  //以每一对原子中点为初猜搜索临界点
8  //产生键径
-5  //处理键径
8  //只保留连接两个片段间的键径和对应的BCP而删除其它的
286-290 //中心分子的原子序号
1-5,38-47,67-76,95-104,175-184,189-218,233-262  //其余分子的原子序号
y  //连接两个片段以外的键径已被删除,这里输入y也删除它们对应的BCP
6  //把当前键径导出为paths.pdb
0  //返回
-4  //修改临界点
2  //删除某些临界点
5  //删除对当前没意义的(3,+1)型临界点
6  //删除对当前没意义的(3,+3)型临界点
0  //返回
6  //把临界点导出为CPs.pdb
然后点击键临界点还是index很大

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-18 21:24:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445(ht ...

老师我主要想看一下里面的BF4离子和外面原子相互作用的强弱

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发表于 Post on 2024-3-20 23:24:16 | 只看该作者 Only view this author
你没点到键径上,就不可能有那么大的index号
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-21 15:30:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-20 23:24
你没点到键径上,就不可能有那么大的index号

好的谢谢老师

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