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[CP2K] 求助CP2K AIMD计算每一步使用的时间越来越长

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老师们好:
我是最近学习利用CP2K软件跑AIMD,在计算过程中每一步使用的时间越来越长!期间我改过&DFT  &QS EXTRAPOLATION的方法以及调整EXTRAPOLATION_ORDER的值,但是这些都没有什么用?在这里想请教各位老师,有什么办法可以解决吗?我附上了我的inp文件(包含结构信息)、提交命令文件以及结果文件。

H.inp

16.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 12

plumed.dat

730 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

YH_aimd.sh

930 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

H-1.ener

16.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

cp2.out.zip

1.2 MB, 下载次数 Times of downloads: 4

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发表于 Post on 2024-4-6 23:23:34 | 只看该作者 Only view this author
自旋多重度为1,为啥用UKS?另外,跑动力学建议用DZVP

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-6 23:33:33 | 只看该作者 Only view this author
reid 发表于 2024-4-6 23:23
自旋多重度为1,为啥用UKS?另外,跑动力学建议用DZVP

谢谢回答!我去试一试

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发表于 Post on 2024-4-7 05:44:14 | 只看该作者 Only view this author
绝对不要用糟糕的PSOLVER ANALYTIC。三维周期性体系一律用PSOLVER PERIODIC
跑动力学没事甭用BLYP,Multiwfn默认用的PBE比BLYP是明显更好选择
热浴一律用CSVR甭用过时的NOSE
动力学过程不要用PRINT_LEVEL MEDIUM,否则提升不少耗时,输出文件还贼老长,监控SCF收敛之类都不方便

若缺乏CP2K相关知识,Multiwfn直接产生的CP2K输入文件里的默认设置若无明确理由不要瞎改
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-7 09:16:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-7 05:44
绝对不要用糟糕的PSOLVER ANALYTIC。三维周期性体系一律用PSOLVER PERIODIC
跑动力学没事甭用BLYP,Multiw ...

好的老师,谢谢提醒!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-7 10:03:33 | 只看该作者 Only view this author
Yhang 发表于 2024-4-7 09:16
好的老师,谢谢提醒!

老师,我跑AIMD的目的是为了后续构建势能模型,所以将PRINT_LEVEL设置为MEDIUM。此外,我还遇到了forrtl: severe (41): insufficient virtual memory这样的报错,有什么方法可以解决吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-7 10:05:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-7 05:44
绝对不要用糟糕的PSOLVER ANALYTIC。三维周期性体系一律用PSOLVER PERIODIC
跑动力学没事甭用BLYP,Multiw ...

老师,我跑AIMD的目的是为了后续构建势能模型,所以将PRINT_LEVEL设置为MEDIUM。此外,我还遇到了forrtl: severe (41): insufficient virtual memory这样的报错,有什么方法可以解决吗?

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发表于 Post on 2024-4-8 02:33:00 | 只看该作者 Only view this author
Yhang 发表于 2024-4-7 10:05
老师,我跑AIMD的目的是为了后续构建势能模型,所以将PRINT_LEVEL设置为MEDIUM。此外,我还遇到了forrtl: ...

用更大内存机子跑,或者减少MPI进程数
也可能当前并行有问题。监控一下计算过程中内存使用量,如果越到后来内存占用率越高,说明当前MPI库可能有问题,跟编译时用的MPI库不符,或者当前的MPI不兼容当前CP2K版本之类。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-8 09:48:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-8 02:33
用更大内存机子跑,或者减少MPI进程数
也可能当前并行有问题。监控一下计算过程中内存使用量,如果越到 ...

谢谢老师,我先去看看

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