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[Multiwfn使用咨询] 求助multiwfn生成cp2k输出文件报错

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各位老师好,我用vmd生成了个体相水的pdb文件,生成cp2k的输入文件后,运行出错

WATER_PBE_NVT.inp

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发表于 Post on 2024-4-14 02:41:21 | 只看该作者 Only view this author
连结构文件都没有,别人无从判断
若无特殊情况,Multiwfn载入pdb文件后直接产生输入文件,甭引用外部结构文件免得有额外事端

甭用DZVP-GTH这么糟糕的基组,而且当前是纯泛函计算,用HFX_BASIS里定义的作甚,明明那是专门给HF计算优化的基组。而且你用的全是赝势基组,既然不用全电子基组写METHOD GAPW做什么,显然应当用GPW。缺乏基本常识的情况下绝对不要乱改基组、基组文件、计算设置。若没特殊情况,MD一律老老实实用PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH。另外,强烈建议参加北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)好好补补CP2K相关知识,免得知识漏洞百出、犯了低级错误还浑然不知。
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-14 11:13:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-14 02:41
连结构文件都没有,别人无从判断
若无特殊情况,Multiwfn载入pdb文件后直接产生输入文件,甭引用外部结构 ...

十分感谢sob老师的指正,今年的培训我一定会申请参加
我的解决方法是:我把VMD生成的水盒子的盒子边界略微扩大了一点,然后跑了一下lammps,取最后一帧,输出pdb文件,然后再用multiwfn,生成cp2k文件。发现是可以跑的

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