“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1501|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求问支持文献里结构的XYZ坐标怎么么导入gaussview里

[复制链接 Copy URL]

2

帖子

0

威望

31

eV
积分
33

Level 2 能力者

求助

202404231012125761..png (43.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 37)

202404231012125761..png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126147

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-4-23 11:04:44 | 只看该作者 Only view this author
自己手动编辑成gjf的格式
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

4322

帖子

4

威望

9728

eV
积分
14130

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

3#
发表于 Post on 2024-4-23 12:25:39 | 只看该作者 Only view this author
复制到文本编辑器(如Sublime Text3, Vim)中改改就行,就几秒时间
自动做多参考态计算的程序MOKIT

15

帖子

0

威望

884

eV
积分
899

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2024-4-23 16:40:48 | 只看该作者 Only view this author
把第一行"Atom ...."替换成"#P OPT B3LYP/6-31G*",其他内容不变,修改后的文件名后缀为.gjf,如1.gjf,然后拖入gaussview中就可以了

67

帖子

0

威望

414

eV
积分
481

Level 3 能力者

5#
发表于 Post on 2024-4-23 20:16:10 | 只看该作者 Only view this author
我一般直接打开一个其他的gjf文件然后把坐标部分delete掉然后c v 过去,重设关键词(不知道会不会出问题)

1

帖子

0

威望

7

eV
积分
8

Level 1 能力者

6#
发表于 Post on 2026-3-18 22:16:59 | 只看该作者 Only view this author
可以用Avogadro转化为能被GaussView识别的.gjf格式,不过Avogadro限制了有效数字的位数,可能会影响原始数据坐标精度。

这里提供一个Windows环境下的quick fix,用脚本执行简单的文本操作,即可完成无损转换。

附件便是一个脚本程序,在不改变原始数据的精度的前提下,能够把模拟计算的原始结果(.xyz) 转化为GaussView能打开的.gjf格式。
具体使用步骤如下:
1 下载附件 xyz2gjf.txt
2 把后缀.txt 改成 .bat
2 请将xyz2gjf.bat放入目标.xyz文件所在的文件夹,双击运行,便可将所在文件夹内的xyz全部转换

202603182212208224..png (33.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

202603182212208224..png

xyz2gjf.txt

726 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 1

793

帖子

15

威望

3382

eV
积分
4475

Level 6 (一方通行)

鸩羽

7#
发表于 Post on 2026-3-19 03:09:58 | 只看该作者 Only view this author
er1cz 发表于 2026-3-18 22:16
可以用Avogadro转化为能被GaussView识别的.gjf格式,不过Avogadro限制了有效数字的位数,可能会影响原始数 ...

推荐使用xyzTrick,无需转换成gjf文件,可将xyz文件当作gview可识别格式般双击打开
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=63020
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 18:10 , Processed in 1.966775 second(s), 29 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list