求助关于柔性体系键解离能BDE的计算方法

zh7729 · 发表于 Post on 2024-5-3 20:32:12

各位老师好，我现在想计算一个链状烷烃C-H键的键解离能(BDE)，因为链的柔性比较大，所以想请教各位老师以下三个方法哪种是计算此体系键解离能的正确方法(各种方法均对焓进行校正)：

(1)通过构象搜索找到分子能量最低的构象，将直接在分子的相应位置上去掉H后得到的自由基进行结构优化(不对自由基进行构象搜索)；

(2)通过构象搜索找到自由基能量最低的构象，将直接在自由基上补H得到的分子进行结构优化(不对分子进行构象搜索)；

(3)分别对分子和自由基进行构象搜索找到两者能量最低的构象。

谢谢各位老师

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-3 23:21:36

看具体是什么链状烷烃。如果不是很长，直链构象肯定是能量最低的，都不用纠结这个。而且要看BDE计算什么位置的，构象的选择可能带来多大影响。
通常1较合适

zh7729 · 发表于 Post on 2024-5-4 08:43:45

sobereva 发表于 2024-5-3 23:21
看具体是什么链状烷烃。如果不是很长，直链构象肯定是能量最低的，都不用纠结这个。而且要看BDE计算什么位 ...

明白了，谢谢老师的耐心解答！

MercuryLamp · 发表于 Post on 2024-5-4 11:43:17

sobereva 发表于 2024-5-3 23:21
看具体是什么链状烷烃。如果不是很长，直链构象肯定是能量最低的，都不用纠结这个。而且要看BDE计算什么位 ...

老师，借楼请教一下，为什么不用(3)对分子和自由基都找到能量最低构象呢

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-4 17:11:36

MercuryLamp 发表于 2024-5-4 11:43
老师，借楼请教一下，为什么不用(3)对分子和自由基都找到能量最低构象呢

对于长链柔性体系，势能面复杂、能量最低一批构象近近简并。按3的话，可能由于采样不充分，或者理论计算级别的误差，导致原本状态和自由基状态搜索出来的能量最低构象存在明显差异，这样一来计算BDE时误差也难以充分抵消。而且3还需要对自由基做构象搜索，对计算资源消耗还大。

MercuryLamp · 发表于 Post on 2024-5-4 20:09:27

sobereva 发表于 2024-5-4 17:11
对于长链柔性体系，势能面复杂、能量最低一批构象近近简并。按3的话，可能由于采样不充分，或者理论计算 ...

原来如此，感谢老师的解答

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