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[CP2K] CP2K可以在结构优化时计算REPEAT电荷吗

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楼主
之前看到社长博文里面有使用CP2K计算REPEAT电荷的例子,但我不知道使用Multiwfn生成MOF结构优化脚本的时候是否可以选择同时计算REPEAT和输出.cube文件用来计算DDEC电荷?还是说必须优化完成另外开一个单点能的计算再去计算电荷呢

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发表于 Post on 2024-5-14 15:12:35 | 只看该作者 Only view this author
我每次都是另开一个单点。我记得选上molden文件的话,每优化一步都会生成一个。不知道电荷和cube文件会不会。

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发表于 Post on 2024-5-14 17:32:17 | 只看该作者 Only view this author
别跟结构优化搅合在一起,应当单独用个任务
只需要计算REPEAT电荷就够了,原理上比任何其它原子电荷都更适合做MOF体系的基于力场的模拟的目的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-14 17:45:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-14 17:32
别跟结构优化搅合在一起,应当单独用个任务
只需要计算REPEAT电荷就够了,原理上比任何其它原子电荷都更适 ...

好的谢谢社长。我还有两个问题想请教一下:
1. 我看到您给出的MOF-5计算REPEAT电荷是同类型原子电荷都是相等的,这是做了什么特殊处理吗,我计算自己MOF的REPEAT电荷同类原子都是有差异,我需要特殊操作或者做平均处理吗?
2. 我用CP2K优化一个立方晶胞的MOF,优化出来的三个方向的晶格常数不相等,有一些差别,我尝试过保持对称性的操作,还是会有点差异,不过一般都差的很小,这是正常的吗,还是有办法保持一致呢。我看到别人给出DFT优化结果晶格常数都是相等

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发表于 Post on 2024-5-14 23:13:43 | 只看该作者 Only view this author
thor 发表于 2024-5-14 17:45
好的谢谢社长。我还有两个问题想请教一下:
1. 我看到您给出的MOF-5计算REPEAT电荷是同类型原子电荷都是 ...

1 空间上(而不是化学上)等价原子才可能REPEAT电荷相等。另外,即便空间上等价,若CUTOFF比较糙的话,有可能由于静电势格点精度不够,导致拟合出来的原子电荷不等价。你可以对等价原子取平均

2 如果你用KEEP_SYMMETRY T并且&FORCE_EVAL / &SUBSYS / &CELL / SYMMETRY设了CUBIC的话,不应该算完了边长不同
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-5-15 09:25:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-5-14 23:13
1 空间上(而不是化学上)等价原子才可能REPEAT电荷相等。另外,即便空间上等价,若CUTOFF比较糙的话,有 ...

好的,非常感谢社长解惑

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