关于阳离子体系的电子密度差解释

lycheeho · 发表于 Post on 2024-5-24 14:58:29

大家好，我想通过计算两个分子间的气相电荷转移来研究分子间的相互作用。所研究体系是两个相同的带+2价的稠环芳烃分子，分子间距为2.3 A左右根据Sob老师详细的计算步骤，发现分子间有明显的电荷累积，而如果两个分子是中性的话就没有。这样得到的计算结果是否说明对于阳离子体系，两个分子间的相互作用更强，这样分析是否合理？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-5-24 15:08:47

首先，这种足够大的共轭体系的最稳定结合构象是面对面堆积。先用构象搜索把正确的结合构象找到了，再谈别的。
其次，衡量相互作用强弱应该用结合自由能，而非电荷累积

lycheeho · 发表于 Post on 2024-5-24 15:16:38

wzkchem5 发表于 2024-5-24 15:08
首先，这种足够大的共轭体系的最稳定结合构象是面对面堆积。先用构象搜索把正确的结合构象找到了，再谈别的 ...

谢谢您及时的回复！不好意思，是我没有说明白，分子排列方式是按照分子在金属表面的实验图像来排的，目的是定性说明为什么分子采取这样的组装方式。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-5-24 15:34:42

lycheeho 发表于 2024-5-24 08:16
谢谢您及时的回复！不好意思，是我没有说明白，分子排列方式是按照分子在金属表面的实验图像来排的，目的 ...

那就不应该做气相计算，必须考虑金属基底，哪怕金属基底用一个很低的理论级别也行。金属基底对分子间作用影响很大

lycheeho · 发表于 Post on 2024-5-24 16:09:06

wzkchem5 发表于 2024-5-24 15:34
那就不应该做气相计算，必须考虑金属基底，哪怕金属基底用一个很低的理论级别也行。金属基底对分子间作用 ...

确实，但是考虑金属就会复杂很多，想着能不能利用简单的气相模型来解释，谢谢您！

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