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楼主 Author: sobereva
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[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn观看分子轨道

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发表于 Post on 2017-11-10 15:05:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-11-9 15:31
确保用的是最新版本。老版本-3是在主界面里,3.4.1版被挪到主功能6里了。

用的版本是3.4,不知是不是最新的

0NO{I}F17$D$QS~QCSW4VEM.png (65.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 187)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-10 17:59:56 | 只看该作者 Only view this author
wudazhuang509 发表于 2017-11-10 15:05
用的版本是3.4,不知是不是最新的


主页上的总是最新的,现在是3.4.1
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发表于 Post on 2017-12-5 10:36:54 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,我想问下,我想知道某一个氨基酸对应哪些轨道,这个可以看出来吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-5 16:50:17 | 只看该作者 Only view this author
853474282 发表于 2017-12-5 10:36
sob老师,我想问下,我想知道某一个氨基酸对应哪些轨道,这个可以看出来吗


这个问题本身就是错误的
如果你是指的分子轨道,通常是呈高度离域的,没有哪个分子轨道直接对应哪个片段之说。顶多是计算各个分子轨道中,体系中氨基酸那一部分对轨道的贡献是多少。(看《谈谈轨道成份的计算方法》http://sobereva.com/131
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-7 23:10:30 | 只看该作者 Only view this author
鉴于貌似有些人由于不会用Multiwfn误以为Multiwfn直接显示的轨道图形效果不好,我在此文第2节末尾加入了“总结:用Multiwfn直接绘制出好看的分子轨道图的一般建议流程”部分,按照这个建议可以很容易得到效果很不错的图,虽然比不上Multiwfn+VMD的组合,但也起码比gview强得多,和chemcraft效果至少能达到持平。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-2-14 23:11:47 | 只看该作者 Only view this author
更新了Multiwfn,支持了此功能:
将当前绘图设置(颜色、视角、分子显示方式、绘制轨道用的格点数等等)保存到当前目录下的GUIsettings.ini。以后只要选择载入GUIsettings.ini的选项,就可以立刻恢复之前的绘图设置
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-21 01:32:59 | 只看该作者 Only view this author
应Multiwfn用户的需求,今日更新了官网上的Multiwfn,可以在主功能200的子功能3里直接基于HOMO、LUMO序号选择要导出的轨道,相应地在本文中增加了下面这段
在这个界面里,如屏幕上的提示所示,还可以基于HOMO、LUMO来选择要计算的轨道。比如输入h就代表选择HOMO、输入l就代表选择LUMO、h-3代表HOMO-3、l+2代表LUMO+2。对于非限制性开壳层波函数,还可以用比如ha-3代表alpha的HOMO-3、用比如lb+5代表beta的LUMO+5。不过这种方式选择轨道一次只能选择一个。
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发表于 Post on 2022-6-27 18:38:59 | 只看该作者 Only view this author
社长,请问有通过脚本批量的把一大批分子的HOMO和LUMO轨道保存成图片的方法吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-29 01:42:31 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2022-6-27 18:38
社长,请问有通过脚本批量的把一大批分子的HOMO和LUMO轨道保存成图片的方法吗?

结合VMD可以。写脚本对一批分子都产生HOMO、LUMO的cub文件,然后在VMD里写tcl脚本,依次读入,并且用绘图命令保存图片

之前论坛上有不止一个相关帖子,比如
http://bbs.keinsci.com/thread-10686-1-1.html

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发表于 Post on 2023-3-26 13:42:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Freeman 于 2023-3-26 13:45 编辑

社长,请问怎么用Multiwfn看gamess-us的局域轨道?gamess-us的局域轨道保存在gms文件的末尾(格式和正则轨道相同但没有轨道能量和虚轨道),用Multiwfn只能看到文件前面的正则轨道。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-27 00:53:26 | 只看该作者 Only view this author
Freeman 发表于 2023-3-26 13:42
社长,请问怎么用Multiwfn看gamess-us的局域轨道?gamess-us的局域轨道保存在gms文件的末尾(格式和正则轨 ...

自己写个程序转换格式,或者手动把定域化轨道部分信息覆盖MO部分
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