cp2k安装过程报错

Dopamine · 发表于 Post on 2024-6-26 16:09:45

本帖最后由 Dopamine 于 2024-6-26 16:29 编辑

各位老师，我在安装cp2k的过程中遇到了一些问题：
1. MKL和GCC版本：
source /share/apps/intel/oneapi/mkl/2021.4.0/env/vars.sh
source /share/apps/intel/oneapi/mpi/2021.4.0/env/vars.sh

source /opt/rh/devtoolset-9/enable

2. toolchain:
执行：./install_cp2k_toolchain.sh --with-gcc=system --with-intel=no --with-openmpi=install --math-mode=mkl --with-scalapack=no --with-ptscotch=install --with-superlu=install --with-pexsi=install --with-quip=install --with-plumed=install （如果不加--with-gcc=system和--with-intel=no, libint编译不过去）后一切正常，无报错。

3. copy arch/* ../../arch ; source install/setup

4. 编辑CP2K
编译CP2K的命令为make -j 60 ARCH=local VERSION="psmp popt"，但马上就报错，具体如图所示，想请教一下各位老师，这种情况该怎么办

snljty2 · 发表于 Post on 2024-6-26 16:23:40

如果你不用Intel的MPI，建议不要加载Intel MPI的环境，以免某些脚本处理弄混。没有看到你的描述，运行完toolchain后有执行

source tools/toolchain/install/setup

复制代码

嘛？

Dopamine · 发表于 Post on 2024-6-26 16:28:33

snljty2 发表于 2024-6-26 16:23
如果你不用Intel的MPI，建议不要加载Intel MPI的环境，以免某些脚本处理弄混。没有看到你的描述，运行完too ...

谢谢老师的回复，我试一下不加载的情况。拷贝arch/*和source setup我都已经做了，我没写清楚，不好意思

Santz · 发表于 Post on 2024-6-27 10:47:54

没有试过 2023.1，给你分享一下我编译 2023.2 的过程

CentOS7.9 + CP2K-2023.2
module load cmake/3.29.3 mkl/intel/oneapi-2022.3.1 compilers/gcc/9.3.0
./install_cp2k_toolchain.sh --with-gcc=system --with-intel=no --with-cmake=system --with-openmpi=install --with-plumed=install
CentOS8.5 + CP2K-2023.2
module load cmake/3.29.3 mkl/intel/2020.4 compilers/gcc/9.3.0
./install_cp2k_toolchain.sh \
--with-gcc=system \
--with-intel=no \
--with-cmake=system \
--with-openmpi=install \
--with-ptscotch=install \
--with-superlu=install \
--with-pexsi=install \
--with-quip=install \
--with-plumed=install \
--with-libtorch=install

复制代码

sobereva · 发表于 Post on 2024-6-28 05:35:40

严格按下文用gcc+gfortran+OpenMPI编译，甭惹上Intel编译器和MPI，自找麻烦
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586（http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html）

没理由不编译最新的2024.1

Dopamine · 发表于 Post on 2024-7-1 21:23:12

sobereva 发表于 2024-6-28 05:35
严格按下文用gcc+gfortran+OpenMPI编译，甭惹上Intel编译器和MPI，自找麻烦
CP2K第一性原理程序在CentOS中 ...

谢谢社长的回复，确实是Intel编译器和MPI的问题。

希望给后面的朋友们提个醒，安装cp2k时不要加载Inter的编译器和MPI，严格按照社长的文章去安装cp2k。

zjxitcc · 发表于 Post on 2024-7-2 10:56:42

本帖最后由 zjxitcc 于 2024-7-2 10:59 编辑

Dopamine 发表于 2024-7-1 21:23
谢谢社长的回复，确实是Intel编译器和MPI的问题。

希望给后面的朋友们提个醒，安装cp2k时不要加载Inte ...

可以使用Intel编译器和OpenMPI，不使用/不加载Intel MPI，不要错误地将其视为洪水猛兽，以后的人看到你说的还以为Intel编译器不能编译CP2K。我写过两篇详细的安装教程，安装过几十台机子，做计算都没问题
《离线安装CP2K-2022.2_Intel编译器版》，《离线安装CP2K-2024.1_Intel编译器版》

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