高分子模拟退火失败

爱学习的圈

我建了一个高分子无定型胞，并对他进行退火处理，但是经常遇到这个问题“Dynamics calculation - Aborting dynamics.
An unphysical integration step (>100 Angstroms) has been detected.
Try relaxing the structure with geometry optimization, reducing the time step,
reducing the temperature or a combination of these.”Time step 是按着文献来的，常用的1 fs，结构优化也重复做了很多次了，还是会报出这个问题，请教一下大佬，这是什么原因导致的呢？一般怎么处理的啊

有自学高分子动力学模拟的同学吗，一个人自学太困难了，有想一起讨论学习的评论区回复一下

xju_cy

请问解决了吗？

爱学习的圈

xju_cy 发表于 2024-7-29 16:36
请问解决了吗？

并没有，只能减少时间步数到0.5fs和总的模拟时间

yuzc

爱学习的圈 发表于 2024-10-22 15:34
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直接使用Radonpy就得了。
如果需要自己构建聚合物模型满足特殊需求，也可以在松弛阶段参考Radonpy已经写好的非常规范的21 steps退火法。