计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 113|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 溶液反应自由能变计算中,各物种是否需要使用同一方法处理?

[复制链接 Copy URL]

1

帖子

0

威望

13

eV
积分
14

Level 1 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好!最近我在计算如下反应的自由能变:
Y(aq) + B(OH)4-(aq) → YB-(aq) + nH2O
Y(aq) + B(OH)3(aq) → YB(aq) + nH2O
其中Y为有机分子,YB、YB-为分子与硼酸、硼酸根离子的配合物。根据帖子《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》(sobereva.com/327)和《谈谈弥散函数和“月份”基组》(sobereva.com/119)的内容,我对阴离子YB-(aq)的结构优化后使用了M06-2X/ma-def2-TZVPP基组,再放到Shermo计算G(YB-, g),然后用M05-2X/6-31G*计算了溶解自由能,算出了它的液相自由能G(YB-, aq)。但是,对于中性分子Y(aq)、YB(aq)和其他小分子,是否都需要加上弥散函数进行计算,还是应使用不加弥散函数的版本?即:计算反应自由能是每种反应物/生成物分别算准能量,还是必须统一用相同的方法?当对比不同的Y对硼酸的配位能力时,不同的Y之间是否也需要相同的方法?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-10 23:58:20 | 只看该作者 Only view this author
整个过程中,相同的原子(不是指元素)必须用相同的基组,否则没法求差
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

3

帖子

0

威望

91

eV
积分
94

Level 2 能力者

3#
发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
我也在算类似的配合物体系,请问H2O也需要按其它分子的方法计算G(H2O,g)+校正项+溶解自由能吗?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 06:45 , Processed in 0.172072 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list