计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 234|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 计算完打开过后的chk文件,感觉结构明显不对,且偶极矩结果也不对

[复制链接 Copy URL]

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

各位老师好!这是我计算完打开过后的chk文件,感觉结构明显不对,且偶极矩结果也不对,不知道时什么原因导致的。

202409211524221724..png (43.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

202409211524221724..png

104

帖子

1

威望

1736

eV
积分
1860

Level 5 (御坂)

黄昏粼粼

2#
发表于 Post on 2024-9-21 15:49:54 | 只看该作者 Only view this author
应该上传输入输出文件
愿乘长风,破万里浪

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 16:13:19 | 只看该作者 Only view this author
m-pda.zip (1.92 MB, 下载次数 Times of downloads: 2) 这个压缩包里面包含chk和out文件

m-pdA.mol

1.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

m-pdA.gjf

1.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

49

帖子

0

威望

1134

eV
积分
1183

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2024-9-21 17:09:46 | 只看该作者 Only view this author
zzm666 发表于 2024-9-21 16:13
这个压缩包里面包含chk和out文件

这个体系应该带电吧 电荷设错了应该是 把电荷设成2可以跑完且结果正常

104

帖子

1

威望

1736

eV
积分
1860

Level 5 (御坂)

黄昏粼粼

5#
发表于 Post on 2024-9-21 17:18:06 | 只看该作者 Only view this author
zzm666 发表于 2024-9-21 16:13
这个压缩包里面包含chk和out文件

这个体系不可能是0价,是不是应该为两个氨基?
愿乘长风,破万里浪

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 21:00:51 | 只看该作者 Only view this author
pikachuupup 发表于 2024-9-21 17:18
这个体系不可能是0价,是不是应该为两个氨基?

是的,两个氨基个带一个正电荷,我是从chemdraw3d导入的,不知道为什么不行。

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 21:01:35 | 只看该作者 Only view this author
pikachuupup 发表于 2024-9-21 17:18
这个体系不可能是0价,是不是应该为两个氨基?

是的,两个氨基个带一个正电荷,我是从chemdraw3d导入的,不知道为什么不行。

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 21:04:16 | 只看该作者 Only view this author
老师就是这样的,是有什么问题吗?   我不会从高斯建立3D带点模型,还请老师指教        

8be7534c3952023e2ee786302e29e2a.png (165.69 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

8be7534c3952023e2ee786302e29e2a.png

49

帖子

0

威望

1134

eV
积分
1183

Level 4 (黑子)

9#
发表于 Post on 2024-9-21 21:10:34 | 只看该作者 Only view this author
zzm666 发表于 2024-9-21 21:04
老师就是这样的,是有什么问题吗?   我不会从高斯建立3D带点模型,还请老师指教

你这个是质子化的氨基,氨基应该是-NH2,你把charge设置为2就好了

104

帖子

1

威望

1736

eV
积分
1860

Level 5 (御坂)

黄昏粼粼

10#
发表于 Post on 2024-9-21 21:22:05 | 只看该作者 Only view this author
zzm666 发表于 2024-9-21 21:04
老师就是这样的,是有什么问题吗?   我不会从高斯建立3D带点模型,还请老师指教

楼上正解
愿乘长风,破万里浪

26

帖子

0

威望

45

eV
积分
71

Level 2 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-21 22:11:44 | 只看该作者 Only view this author
谢谢几位老师  感谢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 20:00 , Processed in 0.178316 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list