关于用NEB.sh读取每一步能量，读取不到的问题

THY · 发表于 Post on 2024-9-25 10:26:12

请问各位大佬，我用sober老师的NEB.sh脚本读取每个副本的能量，但是生成的txt文件是空的，显示未能打开NEB_traj.xyz，但是上一步已经生成了A_traj.xyz文件，他为什么要打开NEB_traj.xyz这个文件呢，这个文件从头到尾并不存在呀？
，

logzzz · 发表于 Post on 2024-9-25 10:29:21

把A_traj.xyz改成NEB_traj.xyz或者把脚本里的NEB_traj.xyz改成A_traj.xyz。

PS：你发那没多帖子干什么。

THY · 发表于 Post on 2024-9-25 10:43:31

logzzz 发表于 2024-9-25 10:29
把A_traj.xyz改成NEB_traj.xyz或者把脚本里的NEB_traj.xyz改成A_traj.xyz。

PS：你发那没多帖子干什么。

抱歉，可能网络卡住了，我正在寻找删除帖子的办法

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-25 22:22:24

THY 发表于 2024-9-25 10:43
抱歉，可能网络卡住了，我正在寻找删除帖子的办法

怎么删帖在置顶的社员必读贴里明确写了

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-25 22:24:59

搞清楚脚本用法的逻辑。当前项目名叫NEB，才会产生NEB_traj.xyz、给出NEB_ene.txt。如果项目名是其它的显然命令行里要写的项目名就不是NEB

北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）的ppt说得很清楚：

有了这个才能观看NEB轨迹

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[CP2K] 关于用NEB.sh读取每一步能量，读取不到的问题