计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 124|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn使用咨询] cp2k导出的电子密度和静电势cube计算极值点格点不匹配的问题

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

111

eV
积分
115

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位好,我利用cp2k做DFT计算导出的cube文件(周期性体系,计算需要)可以用卢老师的方法(使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图http://sobereva.com/443)在VMD中成功画出静电势图,由此可以判断cube文件并没有问题。但是,我在利用Multiwfn计算极值点时一直遇到如下问题:
Error: The grid setting of this cube file is inconsistent with that of the grid data stored in memory!

我的具体做法如下:
Multiwfn density.cub
12    //表面定量分析
5      //导入外部cube函数文件
3      //确认选择外部文件进行插值
0      //开始分析,此时会产生cube template file并提示输入静电势cube文件,我在输入esp.cub之后就出现了上述问题

我分析的原因:esp.cub和density.cub 格点是完全一致的,而template.cub是电子密度0.001 a.u.的isosurface cube,所以跟cp2k产生的不可能一致。

那么,如何产生跟template.cub一致的esp.cub呢?(实在是抱歉,cube文件过大,无法上传)

还请大家指点。拜谢


5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112351

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-26 23:01:10 | 只看该作者 Only view this author
目前主功能12不支持周期性体系,以后会支持
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 06:34 , Processed in 0.151208 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list