openmpi安装运行问题

西乡新丰客

卡开发发 发表于 2017-1-8 06:19
哦，你有mpiifort，那看来环境变量有冲突，看看能否在bashrc或profile先注释掉intel的mpi的环境变量，然 ...

抱歉，我没了解您的意思，man mpifort中说是openmpi中带的fortran编译器，我只在.bashrc和profile内设置了intel的ifort的路径，和openmpi的路径，我以前装过mpich但并没有设置环境变量，所以也没有用过mpich。我如果直接./configure  --prefix=/*****/不加F77,FC参数，是可以成功配置的。
您让我注释掉inter的mpi环境变量，可我本来就没有写到bashrc和profile里去，这应该怎么办？谢谢

西乡新丰客

卡开发发 发表于 2017-1-8 06:19
哦，你有mpiifort，那看来环境变量有冲突，看看能否在bashrc或profile先注释掉intel的mpi的环境变量，然 ...

我不是太明白您的意思，因为我并没有在.bashrc或者profile内写入过其他的mpi的环境变量。
我现在觉得问题可能是出在了在根目录下编译fortran程序时，只能用gfortran，只有在主目录～/下才可以用ifort来编译，但是以前我装gfortran时并没有写入过其路径，现在在.bashrc或者profile内也没有其路径，所以我想知道如何使得在根目录下可以用ifort来编译，而不用gfortran来编译。
谢谢

卡开发发

西乡新丰客 发表于 2017-1-8 11:06
我不是太明白您的意思，因为我并没有在.bashrc或者profile内写入过其他的mpi的环境变量。
我现在觉得问 ...

实在不行私下联系，我远程看下好了，实在搞不定再说。

西乡新丰客

卡开发发 发表于 2017-1-8 11:54
实在不行私下联系，我远程看下好了，实在搞不定再说。

好的，谢谢，我自己先试试

西乡新丰客

卡开发发 发表于 2017-1-8 11:54
实在不行私下联系，我远程看下好了，实在搞不定再说。

麻烦您在看下：我将openmpi的路径写入～/.bashrc内source后，把/usr/local/openmpi/example下的*.f90的并行例子cp到主目录～/下用mpifort编译，然后用mpirun运行， 是可以正常运行得出正确的进程数的，但是当我在根目录下编译时，是不能用mpifort来编译的，只能用mpif90来编译，而且编译后再用mpirun运行后会出现一个进程重复np次的情况。我又修改了根目录 下/etc/profile内openmpi的路径，仍然会出现只有一个进程重复np次的情况。
我并没有在.bashrc或者profile内写入过其他的mpi的环境变量。（只有ifort和openmpi的路径。）
我觉得问题是不是在于在根目录下编译fortran程序时，只能用gfortran，而我的gfortran又并没有安装好，所以只有一个进程，重复了np次，而在主目录～/下，由于我在bashrc中写入来openmpi以及ifort的路径，所以可以用ifort来编译。而现在在根目录下仍然是只能用gfortran来编译串行的fortran程序，而不能用ifort来编译，会提示sudo：ifort找不到命令。我想，是不是只要我在根目录下能用ifort编译串行的fortran程序，就可以正确安装openmpi了。这之前出想的./configure --prefix=/***/ F77=ifort FC=ifort所出现的错误也就会没有了。我已經用root下source了/.bashrc以及/etc/profile还是没有用处。
另外有帖子说：“openmpi设置fortran编译器，通过 man mpif90查到在/usr/share/openmpi/mpif90-wrapper-data.txt里面修改配置，内容的话一看就知道了。”我也试过将mpifort-wrapper-data.txtcompiler中compiler参数修改为ifort也没有效果。

kinkeng

西乡新丰客 发表于 2017-1-7 21:30
还有一点，就是，我把/usr/local/openmpi/example下的*.f90的并行例子cp到主目录～/下用mpifort编译，然 ...

虽然不知道具体问题，我觉得可能是权限问题