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[GROMACS] 在GROMACS中如果要用Buckingham势而不是LJ势,top文件应该怎么写呢?

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我想用GROMACS模拟一下碳酸盐熔体,体系中只含有碳酸根离子和金属阳离子,找到了一篇文章,文章中介绍了同一碳酸根内的C-O作用方式和O-O作用方式,以及各种金属阳离子与碳酸根中的O的非键作用方式,文章中用的软件是DL_POLY_2。附上文章链接(https://doi.org/10.1063/1.5082731)我想知道如何把文章中的力场参数用到GROMACS里。看上去文章中定义非键相互作用是用的是Buckingham势而不是LJ势,那么我有以下几个问题:
1,top文件中[ defaults ]字段中,因为我的nbfunc写了2,那comb-rule应该怎么写?
  1. [ defaults ]
  2. ; nbfunc   comb-rule   gen-pairs   fudgeLJ   fudgeQQ
  3. 2                  ?             no             1             1
复制代码
(因为我看到对于Buckingham势只有一种结合规则,那我这儿应该填什么呢?)

2,[ atomtypes ]里的sigma (nm)    epsilon (kJ/mol)该怎么写?文章中也没有给相应原子sigma (nm)    epsilon (kJ/mol)的值,那我应该怎么获得呢?而且我看GROMACS手册sigma (nm)    epsilon (kJ/mol)是使用LJ势的时候才有的参数,那我用Buckingham势该怎么写这个参数呢?


3,对于文章中提到的碳酸根离子内的O-O相互作用我应该怎么用到GROMACS里呢?


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