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[波函数分析求助] 求助计算福井函数f0和绘制出来的等值面图不一致的问题

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各位老师好,我使用Gaussian程序按照博文(http://sobereva.com/484)对一个自由基进行了福井函数的计算,然后绘制了福井函数的等值面图,但是发现福井函数等值面图和数据对不上:两个O原子的f0都是0.15,但是在等值面上其中有一个氧的等值面没有显示,请老师指点。


mmexport1732783310330.png (20.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

mmexport1732783310330.png

mmexport1732783306357.png (131.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

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发表于 Post on 2024-11-28 17:35:14 | 只看该作者 Only view this author
福井函数明明是Multiwfn算的而不是Gaussian算的,描述时不要有误导性

计算方式不当,等值面都被截断了。严格照着博文操作,从头把博文里的例子完整重复一遍,确保用的Multiwfn最新版本、没有手动做多余的事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-28 18:49:31 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师指点,我刚刚重复例子做了一次,首先输入22/1/回车/输入0 2/输入-1 1/输入1 1得到了三个gjf文件,然后调用Gaussian进行计算,得到了三个wfn文件,然后输入2,得到简缩福井函数的数据(没有做关于ωcubic和亲电描述符(ε)的计算)然后输入3,计算福井函数等值面,输入3选择高质量格点,输入3得到f0的等值面图,但依然是有截断的,还是没有解决这个问题。

N.wfn

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N 1.wfn

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N-1.wfn

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发表于 Post on 2024-11-28 18:59:37 | 只看该作者 Only view this author
N 1.wfn改名为N+1.wfn,和N.wfn、N-1.wfn放到Multiwfn目录下,启动Multiwfn载入N.wfn,然后输入
22
3
3
之后选3观看f0,用0.01等值面,如下所示没有任何问题


选7得到f0.cub,用VMD按下文显示,也没任何问题
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-28 19:28:21 | 只看该作者 Only view this author
谢谢卢老师,+符号问题我这边是正常的,可能是上传的时候出现了问题。

问题已经解决了,按照卢老师的步骤成功了,归结原因应该是我没有拖拽N.wfn进Multiwfn导致,而是直接让其读取。

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