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本帖最后由 qingmang 于 2025-2-3 09:42 编辑
这是一个自学且初学者的计算经验总结贴，经验来源于自己的计算经历与师兄的一些建议，主要为了以后自己回想起来这些经验，会随缘更新。欢迎大家讨论，同时也欢迎各位前辈，同学批评指正（轻喷）
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过渡态找不到，虚频变成甲基旋转或者骨架变动：
0、考虑反应是否存在很明显的活性位点（比如质子，孤对电子）通过加入其他成分（酸、碱、溶剂）来惰化
1、利用扫描，刚性扫描比较快速，一般是扫描中能量最低点（毕竟不大可能直接契合那个虚频的对应的方向），但要关注势能曲线不够平滑或者比较特殊的点，
2、在可能结构附近精细（减少步长）扫描，看看有没有合适的原子位置（扫描后的鞍点）
3、减少计算循环的步长（MexStep = 3），可以让某种二阶不稳定的结构找到可能位置（鞍点和鞍点之间亦有稳定性差别）
中间体找不到，出现甲基旋转或者骨架变动的虚频：
0、此种情况一般是势能面上两个点（鞍点与局部最小点）离得很近导致的
1、积极利用recalc，Maxstep（如：recalc=5,maxstep=3）计算二阶导，可以将两个势能面很接近的位点（鞍点，局部最小点）区分
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发表于 Post on 2024-11-30 20:50:54
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