计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 544|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[并行运算] 请教一下双路9654服务器运行Gaussian任务时是否需要绑定核心?

[复制链接 Copy URL]

119

帖子

0

威望

2713

eV
积分
2832

Level 5 (御坂)

今天看到这样一条视频(https://www.bilibili.com/video/BV1obvEebEnk),说是AMD的CPU跑多任务时要绑定核心。我基本跑的都是Gaussian任务,偶尔跑一下ORCA任务,请问如果需要绑定核心的话要如何操作呢?我用的是slurm作业调度系统。我问了下GPT,它说可以添加#SBATCH --cpu-bind=cores             # 确保任务绑定到物理核心指令实现。我又查了一下网页(进程绑定 - 高性能计算导论实验文档),发现有这样的说法:如果进程数没有占满 CPU 物理核心,则自动绑核无法工作, 必须手工指定 上述参数。我在提交作业的时候,经常是单次提交一个24或者12核的,这个说法是我不能通过--cpu-bind=cores自动绑定吗?感觉手动的话又不适合这种多人时不时交作业的场景。我在系统操作这方面有点小白,请各位老师不吝赐教。谢谢!

202412122331378288..png (333.95 KB, 下载次数 Times of downloads: 61)

202412122331378288..png

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120060

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-12-13 01:53:00 | 只看该作者 Only view this author
参考北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KBQC)的幻灯片:
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

2407

帖子

1

威望

5948

eV
积分
8375

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2024-12-13 09:21:03 | 只看该作者 Only view this author
机器如有调度器, 比如slurm,
高斯自己的%cpu=x-y这种, 并无法准确工作.

作业任务非全核心的时候, 用户并不能晓得, 自己拿到的CPU核心的编号.

直接写%nproc即可, CPU核心编号以及绑定/资源限定/资源隔离等工作, 都会有调度器完成.
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 17:16 , Processed in 0.198678 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list