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[任务提交/队列管理] slurm进行vasp资源分配运行后cpu为什么是闲置的

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本帖最后由 guangwu 于 2025-2-15 18:13 编辑

老师们好
1.我想请教一下为什么利用slurm管理cpu运行后cpu仍然处于闲置状态。然后slurm任务是处于排队状态


2.此外,想像各位老师请教一下,为什么使用taskset -c 0-71 mpirun -n 72 -genv OMP_NUM_THREADS=1 vasp_std运行脚本后,vasp显示调用了72核心却只能调用一半

3.为什么使用mpirun -np n vasp_std命令调用18和24并行的时候能看见跨组的两个cpu在运行是否和我的INCAR文件设置有关(使用vaspkit生成的,对NCORE和EDIFF进行了修改)
Global Parameters
ISTART =  0            (Read existing wavefunction, if there)
NELMDL =  6
ISPIN  =  2            (Non-Spin polarised DFT)
# ICHARG =  11         (Non-self-consistent: GGA/LDA band structures)
LREAL  = AUTO       (Projection operators: automatic)
LREAL  = .FALSE.       
ENCUT  = 400        (Cut-off energy for plane wave basis set, in eV)
NCORE  =  5
# PREC   =  Accurate   (Precision level: Normal or Accurate, set Accurate when perform structure lattice relaxation calculation)
LWAVE  = .TRUE.        (Write WAVECAR or not)
LCHARG = .TRUE.        (Write CHGCAR or not)
ADDGRID= .TRUE.        (Increase grid, helps GGA convergence)
# LVTOT  = .TRUE.      (Write total electrostatic potential into LOCPOT or not)
# LVHAR  = .TRUE.      (Write ionic + Hartree electrostatic potential into LOCPOT or not)
# NELECT =             (No. of electrons: charged cells, be careful)
# LPLANE = .TRUE.      (Real space distribution, supercells)
# NWRITE = 2           (Medium-level output)
# KPAR   = 2           (Divides k-grid into separate groups)
# NGXF    = 300        (FFT grid mesh density for nice charge/potential plots)
# NGYF    = 300        (FFT grid mesh density for nice charge/potential plots)
# NGZF    = 300        (FFT grid mesh density for nice charge/potential plots)

Electronic Relaxation
ISMEAR =  1            (Gaussian smearing, metals:1)
ISPIN  =  2
SIGMA  =  0.2         (Smearing value in eV, metals:0.2)
NELM   =  500           (Max electronic SCF steps)
NELMIN =  6            (Min electronic SCF steps)
EDIFF  =  2E-05        (SCF energy convergence, in eV)
# GGA  =  PS           (PBEsol exchange-correlation)

Ionic Relaxation
NSW    =  100          (Max ionic steps)
IBRION =  5            (Algorithm: 0-MD, 1-Quasi-New, 2-CG,5-phono)
ISIF   =  2            (Stress/relaxation: 2-Ions, 3-Shape/Ions/V, 4-Shape/Ions)
EDIFFG = -2E-02        (Ionic convergence, eV/AA)
# ISYM =  2            (Symmetry: 0=none, 2=GGA, 3=hybrids)
POTIM  =  0.015
NFREE  =  2            (ZPVE calculation)




使用的是wsl2中的ubuntu22.04LST,使用的oneapi23版本的编译器,然后装的是vasp.6.3.2

学生已经翻阅了许多帖子,尝试过但是仍然只能运行36核数(使用命令)

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202502151651243557..png

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QQ20250215-165758.png

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QQ20250215-165544.png

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发表于 Post on 2025-2-17 11:41:32 | 只看该作者 Only view this author
看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1.html版头超级巨大的红字提示得极其明确。这次给你移动了,下次如果普通学术求助帖再发到“公社大厅”板块,直接删帖+记违规+扣分处理。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-4 16:34:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-17 11:41
看清楚板块再发贴,求助学术贴不得发到“公社大厅”板块,公社大厅板块http://bbs.keinsci.com/forum-79-1. ...

谢谢sob老师,我已经通过装Windows资源控制台解决了,实在不好意思

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