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[Gaussian/gview] 运行GaussView报错显示段错误

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显示段错误。

1743395451802.png (19.3 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

1743395451802.png

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发表于 Post on 2025-3-31 13:29:39 | 只看该作者 Only view this author
Ubuntu运行GaussView段错误解决方案‌
1. 环境配置检查与修复‌

依赖库安装‌

确保已安装mesa-libGLU等图形库,部分系统需手动安装:

sudo apt install mesa-utils libglu1-mesa  

(若安装后仍报错,尝试降级或更新GTK版本)‌。

环境变量配置‌

检查.bashrc或.zshrc中的路径设置,确保LD_LIBRARY_PATH包含GaussView的lib目录:

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/gv/lib  

避免路径拼写错误或权限问题‌。
2. 段错误调试与日志分析‌

生成并分析Core Dump文件‌

启用系统核心转储功能:

ulimit -c unlimited  
sudo sysctl -w kernel.core_pattern=/tmp/core-%e.%p  

复现错误后,使用gdb调试:

gdb /path/to/gv /tmp/core.<pid>  

输入bt查看崩溃时的堆栈跟踪,定位具体代码位置‌。

查看系统日志‌

通过dmesg或/var/log/syslog排查错误详情:

dmesg | grep "segfault"  
grep "segfault" /var/log/syslog  

根据日志中的内存地址或线程信息进一步分析‌。
3. 软件安装与兼容性优化‌

重新安装GaussView‌

校验安装包完整性(如MD5值),确保解压过程无损坏。
将GaussView安装在纯英文路径下,避免特殊字符或空格‌。

兼容性调整‌

对于老旧硬件或Ubuntu高版本,尝试更换图形渲染模式:

export LIBGL_ALWAYS_SOFTWARE=1  # 强制使用软件渲染  

或使用Mesa替代闭源驱动‌。
4. 内存与资源限制调整‌

显式设置内存限制‌

在Gaussian输入文件(.gjf)中添加内存分配指令:
text

%Mem=2GB  # 根据系统内存调整  

避免内存溢出导致段错误‌。

解除栈大小限制‌

在终端中运行:

ulimit -s unlimited  这个方法解决的比较常见

防止递归或复杂计算时的栈溢出‌。
5. 其他潜在问题排查‌
文件权限问题‌:确保~/.gaussian目录及临时文件(如Gau-*.inp)的用户读写权限‌。
第三方插件冲突‌:禁用自定义脚本或插件,排查兼容性问题‌。
硬件加速异常‌:尝试禁用GPU加速(若支持),或更新显卡驱动‌。

注‌:若仍无法解决,建议提供完整的错误日志和gdb堆栈跟踪信息,以便进一步定位代码级问题‌。

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发表于 Post on 2025-3-31 14:17:17 | 只看该作者 Only view this author
那叫GaussView,别图省事写成view,标题就仅仅写成“view报错”更是严重违规!这次给你改了,下次直接删帖扣分处理,并且认真看此文http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-31 14:22:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-3-31 14:17
那叫GaussView,别图省事写成view,标题就仅仅写成“view报错”更是严重违规!这次给你改了,下次直接删帖 ...

好的,我之前非常注意,写的非常详细,但是平台不能发,说我写的内容存在违规内容,缩减到这个程度才能发出来。

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发表于 Post on 2025-3-31 14:56:17 | 只看该作者 Only view this author
之前我在虚拟机里也遇到了类似问题,你可以参考下我之前的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-46740-1-1.html大家在里面给出了一些解决办法

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发表于 Post on 2025-3-31 15:00:00 | 只看该作者 Only view this author
paperz 发表于 2025-3-31 14:22
好的,我之前非常注意,写的非常详细,但是平台不能发,说我写的内容存在违规内容,缩减到这个程度才能发 ...

帖子标题不可能不能出现GaussView
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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