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[CP2K] 怎么获得CP2K做MM时的力场文件

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本帖最后由 ljc2877437407 于 2025-4-9 22:13 编辑

各位老师好,想请教一下怎么获得CP2K做QMMM时的力场文件呢,比如溶剂MM是乙腈,溶质QM吡啶(这里随便举的例子,可能不合适)

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发表于 Post on 2025-4-9 22:40:50 | 只看该作者 Only view this author
用AmberTools产生分子的拓扑文件,给CP2K用。CP2K支持AMBER、NAMD/CHARMM的拓扑文件

在北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)的“分子力学与QM/MM计算”部分有MM和QM/MM计算的非常详细完整的例子
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-10 15:28:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ljc2877437407 于 2025-4-10 15:48 编辑
sobereva 发表于 2025-4-9 22:40
用AmberTools产生分子的拓扑文件,给CP2K用。CP2K支持AMBER、NAMD/CHARMM的拓扑文件

在北京科音CP2K第一 ...

sob老师,您好。按照您的意思,我将AmberTools文件安装好了,我的模型是乙腈包围了吡啶,只要将pdb文件上传上去,输出力场就可以了嘛,有没有需要特别关注的地方呢

ball.pdb

238.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

模型图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-12 12:28:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-4-9 22:40
用AmberTools产生分子的拓扑文件,给CP2K用。CP2K支持AMBER、NAMD/CHARMM的拓扑文件

在北京科音CP2K第一 ...

sob老师,您好。后面我又去了解到了CHARMM力场,想知道CHARMM力场的par_all36_cgenff.prm文件,适合用于离子液体的溶剂嘛 par_all36_cgenff.zip (137.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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