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[ORCA] 请问orca有没有类似高斯的Link1,计算successive job

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请问orca有没有类似高斯的Link1,计算successive job。
就是在一台机器上,一个作业结束了,不需要手动提交自动计算下一个。

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吃猫咪的鱼

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发表于 Post on 2025-4-30 11:45:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 imasen 于 2025-5-1 21:36 编辑

orca有new_job的功能,具体文档结构可以参考sob老师之前的博文(在ORCA中做counterpoise校正并计算分子间结合能的例子,http://sobereva.com/542),这也可以通过compound脚本实现(https://orca-manual.mpi-muelheim ... amples.html#new-job)。
如果只是要依次将目录下所有的inp文件提交给orca进行计算,用bash shell脚本就能实现:
  1. #!/bin/bash
  2. rm -f Read.txt
  3. ini=$(date +%s)
  4. ncal=0
  5. nfile=`ls *.inp|wc -l`
  6. for inf in *.inp
  7. do
  8. start_time=$(date +%s)
  9. /orcapath/orca ${inf} > ${inf//inp/out}
  10. /orcapath/orca_2mkl ${inf%.*}
  11. ((ncal++))
  12. echo "======== Job ($ncal of $nfile): ${inf} > ${inf//inp/out} ========" >> Read.txt
  13. grep "ORCA TERMINATED" ${inf//inp/out} >> Read.txt
  14. grep ": Error :" ${inf//inp/out} >> Read.txt
  15. grep "error" ${inf//inp/out} >> Read.txt
  16. echo "" >> Read.txt
  17. end_time=$(date +%s)
  18. cost_time=$(($end_time-$start_time))
  19. echo "Cost time is $(($cost_time/3600))h $(($cost_time/60))min $(($cost_time%60))s
  20. " >> Read.txt
  21. done
  22. ono=$(date +%s)
  23. cost_time=$(($ono-$ini))
  24. echo "---------------------------------
  25. === Job TERMINATED !!! ===
  26. ---------------------------------
  27. Total job time is $(($cost_time/3600))h $(($cost_time/60-$cost_time/3600*60))min $(($cost_time%60))s" >> Read.txt
复制代码

每计算完一个inp文件,就会在目录下的read.txt文档里记录一次,包含运行时间,是否正常结束,有没有警告信息等。

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发表于 Post on 2025-5-1 12:39:44 | 只看该作者 Only view this author
参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里全面系统讲ORCA使用一节的例子:

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2025-5-1 13:01:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-1 12:39
参考北京科音高级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KAQC)里全面系统讲ORCA使用一节的例子:

对最新版本的ORCA,似乎开发者的意见(包括2楼链接的compound script对new job的说明,以及ORCA论坛的零星讨论等)是,旧有的$new_job功能即将废弃,改用%compound里的New_step更合适。小声问一句,未来的高级班会考虑这点更新讲义么?

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发表于 Post on 2025-5-1 15:41:08 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-5-1 13:01
对最新版本的ORCA,似乎开发者的意见(包括2楼链接的compound script对new job的说明,以及ORCA论坛的零 ...

看情况。
目前对于这种情况我乐意用$new_job
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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