gromacs怎么进行恒力拉伸？

1900 · 发表于 Post on 2025-5-7 15:58:58

我现在需要用恒力对DNA双链进行拉伸。比如说，DNA双链两端的碱基对之间的拉力是10pN。请问，mdp文件应该怎么写？图片是我目前写的mdp文件，不知道对不对。另外，我想请教一下，pull_coord1_geometry =distance以及direction有什么区别？

FrancisCho · 发表于 Post on 2025-5-8 08:58:37

1900 · 发表于 Post on 2025-5-8 10:30:56

FrancisCho 发表于 2025-5-8 08:58
direction核distance参考http://bbs.keinsci.com/thread-36490-1-1.html

谢谢

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[GROMACS] gromacs怎么进行恒力拉伸？