如何算准一个固体的紫外吸收光谱？

〇66 · 发表于 Post on 2025-5-19 22:29:02

如图是我想计算的一些固体粉末分子的光谱图，最上面是我计算出来的光谱图，中间的是实验测定的光谱，我感觉算出来的和实验对照的有一些差异，有没有什么好的方法让我算的更准一些呢？
这是我计算的这两个分子吸收的文件

关键词 # td=(nstates=6,root=1) wb97xd/6-31g(d,p)

02CHO.zip (24.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

02SBI-06E_wb97xd.zip (13.1 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

sobereva · 发表于 Post on 2025-5-20 06:26:45

很多因素都要注意，看北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KEQC）幻灯片：

当前相对来说最明显问题是，wB97XD算局域激发很容易明显高估激发能（可以尝试PBE0、PBE-1/3、CAM-B3LYP），并且当前没考虑晶体环境。晶体环境的考虑参考：
基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱
http://sobereva.com/579（http://bbs.keinsci.com/thread-20960-1-1.html）
使用CP2K结合Multiwfn对周期性体系模拟UV-Vis光谱和考察电子激发态
http://sobereva.com/634（http://bbs.keinsci.com/thread-28006-1-1.html）

〇66 · 发表于 Post on 2025-5-21 10:53:32

sobereva 发表于 2025-5-20 06:26
很多因素都要注意，看北京科音初级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KEQC）幻灯片：

谢谢老师，很受用，我跟着这个帖子的步骤在进行学习（基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱http://sobereva.com/579），中间遇到了一点小问题可能还想向您请教一下。
目前我做到了批量计算多个frag_0001.gjf、frag_0002.gjf.......文件这一步，我是单独将每个frag的文件上传到Linux系统的超算平台上面进行计算。每个片段分子计算时间大约为几十秒左右，都出现了报错。没有一个跑成功的。
输出文件最后几行如下，可以麻烦老师看看是什么问题吗？谢谢您
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):          0.0018853          0.0014648          0.0013341
Standard basis: TZVP (5D, 7F)
  8476 basis functions, 14820 primitive gaussians,  8840 cartesian basis functions
  1248 alpha electrons    1248 beta electrons
   nuclear repulsion energy 154741.8055082608 Hartrees.
NAtoms=  624 NActive=  624 NUniq=  624 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=T Big=T
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned off.
One-electron integrals computed using PRISM.

sobereva · 发表于 Post on 2025-5-22 04:00:00

〇66 发表于 2025-5-21 10:53
谢谢老师，很受用，我跟着这个帖子的步骤在进行学习（基于背景电荷计算分子在晶体环境中的吸收光谱http:/ ...

光从这没法判断。如果到此任务就终止了，在下文里搜停了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439（http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html）

〇66 · 发表于 Post on 2025-5-22 11:23:08

sobereva 发表于 2025-5-22 04:00
光从这没法判断。如果到此任务就终止了，在下文里搜停了
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http: ...

感谢老师答复。我分析了可能的原因，应该是内存的问题，别的问题都排除了。我换了更小的内存重新计算，这次跑了有半个多小时，然后又出现了新的问题，还是不能正常终止。

这是我的其中一个片段的输入和输出文件。

frag_0001.zip (10.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

frag_0001-out.zip (24.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 1)

wbqdssl · 发表于 Post on 2025-5-22 11:30:55

〇66 发表于 2025-5-22 11:23
感谢老师答复。我分析了可能的原因，应该是内存的问题，别的问题都排除了。我换了更小的内存重新计算，这 ...

参考这楼帖子。
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 2&fromuid=53866

〇66 · 发表于 Post on 2025-5-22 14:47:00

wbqdssl 发表于 2025-5-22 11:30
参考这楼帖子。
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=redirect&goto=findpost&ptid=7593&pid=58742&fr ...

好的好的非常感谢您和sob老师的指点，明白了。应该是这个任务产生的rwf文件太大了，导致空间满了，我删了再试一下。

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