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[新手求助] 想构建锆8配位的锆氧团簇模型,没找到相关的文献

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楼主
想求助各位老师,有相关的锆8配位的锆氧团簇模型文献可以分享嘛,之前按照6配位计算(如附件所示),计算结合能一直有问题,感觉可能是吸附剂构型问题

rgZr.gjf

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发表于 Post on 2025-5-20 22:58:29 | 只看该作者 Only view this author
心 肺 骤 停

Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-8 13:24
……Zr(IV)最经典的化合物之一就是碱式盐ZrOCl2·8H2O,实测其晶体结构包含[Zr4(OH)8(H2O)16]8+阳离子,每个锆由四个水分子和四个桥羟基配位……
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-9 11:30
……不知道你有没有看到这篇计算文章,虽然基组不算很好但至少结构是对的

(小品《开锁》那句经典台词就不复制过来了)
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 2025-5-21 10:21:45 | 只看该作者 Only view this author
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-21 16:09:01 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师的分享,您分享的第2篇文献我之前看过,但不是介绍的是锆的水解复合物吗,我能用这个结构吗,文献介绍四聚体倾向于是更稳定的形式,但四聚体按照他的画法要带8个正电荷,这不会影响我计算阴阳离子的结合能吗(如果材料表面带电,不是有静电吸引的作用吗)
我的吸附剂等电点在4.1左右

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发表于 Post on 2025-5-21 16:53:16 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-5-21 16:09
谢谢老师的分享,您分享的第2篇文献我之前看过,但不是介绍的是锆的水解复合物吗,我能用这个结构吗,文 ...

该带多少正电荷、以什么质子化状态吸附,得看你的体系实际pH和组成,酸碱性条件显然会影响吸附效果
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-21 17:24:53 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-5-21 16:53
该带多少正电荷、以什么质子化状态吸附,得看你的体系实际pH和组成,酸碱性条件显然会影响吸附效果

好的谢谢老师,我还有几个问题想请教一下:

1、我的吸附剂等电点是4.1,吸附实验在pH=7下做的,应该按照带负电画,那是不是有些配位的水分子可以改成OH?

2、但我体系带几个负电荷是可以随意设置的吗?

3、按照带负电绘制完成后,是否还需要按照电中性,加入相应电荷数的抗衡离子?

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发表于 Post on 2025-5-21 18:18:02 | 只看该作者 Only view this author
哈哈哈哈哈aaa 发表于 2025-5-21 17:24
好的谢谢老师,我还有几个问题想请教一下:

1、我的吸附剂等电点是4.1,吸附实验在pH=7下做的,应该按 ...

与pH和pKa相关的计算看https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/9480https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/9602两篇回答,当然要是有实验表征吸附剂的结构那直接建模也好。如果抗衡离子在水溶液里已经电离,而没形成团簇参与吸附,那没必要加。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-21 19:05:11 | 只看该作者 Only view this author
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-5-21 18:18
与pH和pKa相关的计算看https://mattermodeling.stackexchange.com/questions/9480和https://mattermodeli ...

老师能用稍微浅显一点的语言解释一下嘛,优点没大看懂,化学基础有点薄弱

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