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[GROMACS] 刚编译好的Windows版GROMACS 2025.2 (2025/08/03更新)

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本帖最后由 iuseroot 于 2025-8-3 22:11 编辑

更新:
2025/08/03:
1. 应各位网友要求,更新了新的下载链接,有效期1个月。
2. CUDA版本提升至12.8.1,使用50系显卡的网友可以尝试能否正常运行(我没有50系显卡所以无法测试)。





基于GitHub Actions自动化编译,编译器最新版MSVC,保障与Windows的原生兼容性。

运行的操作系统:Windows 10 64-bit 或 Windows 11。
CPU要求:支持AVX2指令的x86_64 CPU (CUDA版也需要满足)。

集成了 FFTW (3.3.10)  OpenBLAS (0.3.29) 和 hwloc 。
集成了 CHARMM36 力场(版本:July 2022)。

使用 OpenMP 并行,没有使用 MPI,因此也无需安装任何MPI库。(因为只考虑单台Windows上多线程并行,所以 OpenMP 可以完全可以满足)
没有集成 PLUMED,也没有集成 libtorch (所以 Neural Network potential 是不支持的)

CPU版本同时包含了单精度的 gmx.exe 和 双精度的 gmx_d.exe 。
CUDA版本只包含单精度的 gmx.exe ,要求系统内安装了 CUDA 12.8.1 或更高版本(因此N卡驱动应该是 572.61 或更高的版本)

关于性能:
我只有一个粗略的结果,仅供参考。
CPU版本:因为MSVC的原因,Windows版显著比Linux版慢很多,所以不建议使用Windows上的CPU版。建议此处提供的CPU版仅用于测试(例如短时间运行测试自己做的tpr能不能跑起来)
CUDA版本:在Windows上原生运行的性能和在WSL中运行Linux版性能几乎一致。与原生Linux系统上运行,大约Windows原生版大约只有90%的性能(也就是说跑5天还是跑5天半的区别)。所以Windows原生的CUDA版GROMACS是完全可以接受的,特别是对于机器有限,不方便装Linux的用户而言。

CUDA版下载(需要登录GitHub账号,有效期至2025/09/02):
(文件名称忘了修改了:写的是cuda1263实际应该是cuda1281,因此请确定系统内的CUDA版本需要是12.8.1或更高版本)
  1. https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/16702746939/artifacts/3675975569
复制代码

CPU版下载(需要登录GitHub账号,有效期至2025/09/02):
  1. https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder/actions/runs/16700634341/artifacts/3675498234
复制代码

GitHub项目链接:
  1. https://github.com/KaneGreen/GROMACS-Windows-Builder
复制代码
欢迎提出issues和PR。
Fork后自行编译的朋友请注意GitHub用户协议,请勿滥用GitHub Actions。

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发表于 Post on 2025-5-22 15:14:51 | 只看该作者 Only view this author
请问没有plumed,colvar可以用吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-29 11:19:11 | 只看该作者 Only view this author
neocc 发表于 2025-5-22 15:14
请问没有plumed,colvar可以用吗

取决于你需不需要这两个模块的功能,不需要用到它们的话就可以用

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发表于 Post on 2025-6-2 02:03:17 | 只看该作者 Only view this author
博主,请问下50系显卡用你的gmx_cuda版本在做限制动力学模拟时出现如下问题,该怎么解决啊

202506020203063433..png (79.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 47)

202506020203063433..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-5 00:06:41 | 只看该作者 Only view this author
小马仙人 发表于 2025-6-2 02:03
博主,请问下50系显卡用你的gmx_cuda版本在做限制动力学模拟时出现如下问题,该怎么解决啊

根据论坛上其他的贴子,可能是我这里用的CUDA版本是12.6,而50系要求12.8
我这里没有50系显卡,我还没有测试

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发表于 Post on 2025-6-5 01:20:16 | 只看该作者 Only view this author
iuseroot 发表于 2025-6-5 00:06
根据论坛上其他的贴子,可能是我这里用的CUDA版本是12.6,而50系要求12.8
我这里没有50系显卡,我还没有 ...

谢谢啦,我在wsl里安装了最新版本的,能够成功运行了

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发表于 Post on 2025-6-27 15:39:31 | 只看该作者 Only view this author
不能下载了呀。

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发表于 Post on 2025-6-27 23:34:40 | 只看该作者 Only view this author
还能分享一次吗

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发表于 Post on 2025-7-17 10:18:02 | 只看该作者 Only view this author
可以再次分享吗,谢谢了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-3 22:12:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 iuseroot 于 2025-8-3 22:13 编辑
loovfnd 发表于 2025-6-27 15:39
不能下载了呀。


@loovfnd  @大王来何 @jlzhang
已补档

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发表于 Post on 7 day ago | 只看该作者 Only view this author
iuseroot 发表于 2025-8-3 22:12
@loovfnd  @大王来何 @jlzhang
已补档

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