关于CO2在水中扩散盒子尺寸和数量问题

hzx · 发表于 Post on 2025-5-30 11:03:19

本帖最后由 hzx 于 2025-6-3 09:41 编辑

我想请教一下各位老师大神，我用Gromacs计算CO2在水中的扩散系数，后续加入不同浓度sss（对苯乙烯磺酸钠）做对照试验，我大致固定水的数量，根据溶解度计算CO2数量，根据水的数量计算盒子体积（大约60个CO2和3000个水，盒子体积计算4.6*4.6*4.6nm）问题：
            1计算盒子体积是否需要考虑CO2的体积？
            2是否需要稍微扩大盒子尺寸到5nm？

            3.做不同浓度加入sss对照实验（跟水比较），需要保证什么是一致，CO2数量，水的数量，盒子尺寸，我暂时保持这三个一致加入sss，由于盒子尺寸不变，会不会对模拟有影响，新手小白想请大神不吝赐教

sobereva · 发表于 Post on 2025-5-30 14:37:54

提问时避免使用不常见的缩写，sss指什么说清楚

hzx · 发表于 Post on 2025-6-3 09:42:22

好的老师，修改了，对苯乙烯磺酸钠，望老师答疑解惑

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