CP2K跑AIMD构建deepmd-kit初始数据集inp文件格式请教

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-2 09:08:28

目前想要用CP2K跑AIMD然后构建deepmd-kit的初始数据集，目前自己写了一个CP2K的inp文件，print里面的格式是按照deepmd-kit官网上面改了一下。但是deepmd-kit上面给的模板里面轨迹文件格式没有，我自己手动添加xyz文件，请问这样对吗？请问各位老师，我这个inp文件写的还有哪里需要更改的吗？

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2025-6-2 10:02:47

这输入文件的原始模板是哪来的？缩进看起来有点难受（）

不知道Pbn6.cif的结构长啥样，只能说可以对照按http://sobereva.com/587方法生成的输入文件检查。

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-2 15:16:25

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-2 10:02
这输入文件的原始模板是哪来的？缩进看起来有点难受（）

不知道Pbn6.cif的结构长啥样，只能说可以对照按 ...

这个输入文件是我一个个打的，只有print的部分是在deepmd-kit官网上面下载的

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-2 15:17:02

这个是Pbn6的cif文件

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-2 15:18:22

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-2 10:02
这输入文件的原始模板是哪来的？缩进看起来有点难受（）

不知道Pbn6.cif的结构长啥样，只能说可以对照按 ...

老师，请问我这样子写inp文件能够去作为deepmd-kit的初始数据集吗？

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2025-6-2 15:40:12

悲观的乐观者发表于 2025-6-2 15:16
这个输入文件是我一个个打的，只有print的部分是在deepmd-kit官网上面下载的

“一个个打”是参考了什么上古老教程/实验室祖传文件或者问ai的结果吗？我很好奇你是不是真的理解每个关键词设置的含义，这样入门CP2K还是挺费劲的，建议还是按二楼链接里提到的做法系统学一遍，然后再说什么DeePMD-kit收集数据的事情。我自己就是这么过来的。

这个叠氮化铅晶体倒是没什么问题。

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-3 15:47:24

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-2 15:40
“一个个打”是参考了什么上古老教程/实验室祖传文件或者问ai的结果吗？我很好奇你是不是真的理解每个关 ...

好的好的，谢谢老师，我这就去试试

吞木木 · 发表于 Post on 2025-6-4 09:14:00

https://bohrium.dp.tech/notebooks/4041480191
这个帖子里边有非常详细的怎么使用cp2k构建deepMD的数据集，针对你的情况，建议你反复观看

悲观的乐观者 · 发表于 Post on 2025-6-6 10:55:40

吞木木发表于 2025-6-4 09:14
https://bohrium.dp.tech/notebooks/4041480191
这个帖子里边有非常详细的怎么使用cp2k构建deepMD的数据集 ...

好的好的，谢谢老师

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