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[新手求助] 求助,水解反应过渡态结构优化报错

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本帖最后由 ReinForceKazuha 于 2025-6-5 18:13 编辑

各位老师大家好,我是Gaussian的入门者,现在想复现该文献的水解反应机理,之前按照sob老师的指导设置了输入文件,但是运行了三个小时后输出文件报错,提示结构优化部属不够导致不收敛(能量没有震荡),除此之外,我在output文件中发现“ Linear search not attempted -- option 19 set.”语句多次出现,计算耗时比较长。我把gjf输入文件作为附件上传了(output文件提示无法上传这么大的附件,截图了部分),想麻烦各位老师批评指正我在计算过程中的不当的地方,我该怎么做才能得到正确的过渡态呢,谢谢!



ts.gjf

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发表于 Post on 2025-6-5 18:59:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chands 于 2025-6-5 19:02 编辑
  1. # opt=(calcfc,ts,noeigentest) freq 6-311++g(d,p) scrf=(smd,solvent=water)
  2. geom=connectivity rm062x
复制代码


你把6-311++g(d,p)换成6-311+g(d,p)试试。社长说了,通常不用给H上弥散(氢负离子除外),可以试试IEFPCM(也就是Gaussian默认的溶剂模型),

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-5 21:14:05 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2025-6-5 18:59
你把6-311++g(d,p)换成6-311+g(d,p)试试。社长说了,通常不用给H上弥散(氢负离子除外),可以试试IEFP ...

好的 非常感谢老师!我再试试!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-5 21:19:31 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2025-6-5 18:59
你把6-311++g(d,p)换成6-311+g(d,p)试试。社长说了,通常不用给H上弥散(氢负离子除外),可以试试IEFP ...

老师您好,我按照您的方式进行尝试,7分钟后就报错了,提示这个
Optimization stopped.
    -- Number of steps exceeded,  NStep=  40
    -- Flag reset to prevent archiving.
请问是需要添加关键词opt=maxcycle=100进行最大步数增加,还是我的初始构型就存在大问题呢?我是按照文献来摆的初始构型
谢谢老师!

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发表于 Post on 2025-6-5 21:30:50 | 只看该作者 Only view this author
ReinForceKazuha 发表于 2025-6-5 21:19
老师您好,我按照您的方式进行尝试,7分钟后就报错了,提示这个
Optimization stopped.
    -- Number ...

试试社长的方法http://sobereva.com/164
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发表于 Post on 2025-6-6 00:47:05 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,试图上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、节约下载耗时。

关键词极其糟糕,M06-2X结合SMD做opt freq是经典的自找难收敛、出虚频的组合,我已经在论坛里说过很多次

初始构型也太烂,O8和H6哪能离得那么近,整体结构和文献里的明显有极大的差异
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-6 17:09:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ReinForceKazuha 于 2025-6-6 17:12 编辑
sobereva 发表于 2025-6-6 00:47
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,试图上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以 ...

非常感谢sob老师的批评指正,那我按照文献所给出的泛函和基组进行计算看能否得到结果,同时对初始构型再次进行调整。
因为文献展示的是优化后的过渡态,opt=ts是需要自己摆初始构型,所以我在这里犯了一点错误,感谢sob老师,我再试试!

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