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[Material Studio] MS软件怎么复现高斯的计算(ZIF-8吸附金属离子)?

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本人纯新手,在看文献的时候发现作者在使用高斯做zif-8结构优化的时候,取了一个小的团簇,以简化计算量。
我的问题是:
1、我在使用MS软件时会发现要用castep模块对其进行优化需要先将该团簇放在一个空盒子里,我的操作是直接使用Build crystal,建立一个盒子之后,组别选择P1,再将该团簇放在里面,不知道这样的做法是否合适?
2、在做zif-8吸附金属离子的平衡构型之前,为了保证框架应有的刚性,作者仅仅让该团簇中间的金属原子保持弛豫,这样做是否合理?

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发表于 Post on 2025-6-7 01:54:36 | 只看该作者 Only view this author
算MOF用簇模型是量子化学计算才必须的(虽然Gaussian也支持周期性计算,但对于三维周期性效率极低,不可能算得动ZIF-8)。用第一性原理程序计算MOF根本不需要用簇模型,直接当周期性体系算就完了
CP2K极其适合算ZIF-8,不仅免费、功能强大、非常流行,算这种体系的效率还远远高于CASTEP,也比Gaussian结合簇模型效率高得多。通过北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)学一遍很容易就能上手算这个。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-7 09:11:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-7 01:54
算MOF用簇模型是量子化学计算才必须的(虽然Gaussian也支持周期性计算,但对于三维周期性效率极低,不可能 ...

感谢大佬 用ms的castep算zif8不用简化下模型吗?比如拿出一部分来算,要不然感觉算不动呢

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发表于 Post on 2025-6-8 01:32:18 | 只看该作者 Only view this author
lss123456 发表于 2025-6-7 09:11
感谢大佬 用ms的castep算zif8不用简化下模型吗?比如拿出一部分来算,要不然感觉算不动呢

CASTEP算得当然慢,强烈不推荐用于算当前体系。跟CP2K比,速度一个是拖拉机一个是法拉利。要不然我干嘛强调让你用CP2K算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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