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[Linux] 多个科学计算软件是否会存在冲突

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本帖最后由 xcgotk 于 2025-7-13 09:52 编辑

本人课题组使用社长贴中推荐过的配置,AMDEPYC7R32*2
因为多人使用,涉猎不深但是比较杂,因此各种软件都可能用到,目前在用/可能用到的有gaussian、vasp、gromacs、lammps,Multiwfn、qvasp
使用ssh工具内网连接控制,使用的是ubuntu20.4
想问的问题有
多个软件的配置是否会冲突
如果有冲突要怎样解决(比如安装虚拟机,建立不同的软件专用)
如果在主机上添加多个用户,开机之后是可以同时连接多个用户吗(不同用户能否同时运行)



感谢大家的回复,当前的方案是将VASP和CP2K分别放在了两个用户中,因为是新手维护,所以比较乱,后续可能考虑重新安装整个系统

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鸩羽

2#
发表于 Post on 2025-6-16 22:18:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wal 于 2025-6-16 22:19 编辑

你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突,别的我不咋用不清楚,要冲突估计就是gcc版本,mpi版本之类的有可能冲突
避免冲突最简单的办法,每个软件都写好env.sh,用哪个source哪个,用完了刷新环境变量,进阶玩法可以用module之类的
可以同时连接多个用户 不会挤掉的
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-16 22:40:55 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-16 22:18
你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突,别的我不咋用不清楚 ...

ssh已修改,谢谢您的回复

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黄昏粼粼

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发表于 Post on 2025-6-17 09:15:10 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 pikachuupup 于 2025-6-17 09:18 编辑

据我所知vasp和orca会因为mpi冲突,一般就是用脚本分别调用,要不就是多开账户
愿乘长风,破万里浪

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发表于 Post on 2025-6-17 10:13:10 | 只看该作者 Only view this author
建议你装Lmod进行管理。

Lmod的配置文件写起来比Environment Modules容易多了,而且没有Environment Modules那么多历史包袱。如果是新的集群的话,建议考虑Lmod。我印象中Lmod是可以读取Environment Modules配置文件的,如果你之前写过Environment Modules配置文件的话,应该可以简单修改后供Lmod使用。

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6#
发表于 Post on 2025-6-20 15:23:42 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-6-16 22:18
你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突,别的我不咋用不清楚 ...

我安装slurm mpi软件在Ubuntu上怎么安装哦,总是版本不对。

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7#
发表于 Post on 2025-7-12 21:30:32 | 只看该作者 Only view this author
会冲突,但是要活学活用好bashrc。我的服务器上安装了G16,orca,gromacs,cp2k,multiwfn,vasp等。其中,vasp会与orca及cp2k有冲突

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