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楼主 Author: Danggui
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[Gaussian/gview] 高斯g_write报错

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-17 13:27:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Danggui 于 2025-7-17 13:29 编辑

老师,按照论坛上面帖子的经验分享尝试了找了很多的TS,发现之前报错的原因应该是因为过渡态找的结构太离谱。昨天晚上跑了一组TS和IRC都没有报错。关于TS和IRC有三个问题:
1.来源此帖子http://sobereva.com/400的这部分,IRC一定要跑出下方的的曲线形状才是对的吗,在这篇帖子中提到的随便找的例子中我的理解是只要两端的反应物和生成物趋势是对的,没有跑出该完美曲线也能算对吗?

Q我的IRC看起来比较怪,合理么?怎么边上还凸起来一块?(下图为笔者随便找的例子)
A:很正常。只要确信自己计算流程合理,而且轨迹看着无异常,TS位置曲线也平滑,就没有问题。出现诸如肩峰往往暗示这个反应涉及的电子结构变化复杂,可能整个反应虽然是一步,却呈现出两个阶段,应当结合结构变化特征、波函数分析手段(比如用Multiwfn分析反应过程中键级、ELF、密度差、原子电荷变化等)予以考察。
2.针对Cu-EDTA的反应,方法仍为def2svp pbe1pbe,在此条件下虚频为-398.96,趋势是对的,但是IRC跑得出来的曲线很奇形怪状,只会显示我的产物的,反应物的样子没有显示出来但也没有报错,这种情况是我的TS还是没有找对吗。在TS中我设置的C-N键长我粗猜距离应该设置了超过2倍,设置1.3倍左右的时候分子堆积在一起,很容易报错,这种情况是再调TS吗,还是IRC还是可以继续用

3.跑CuOH-H时,方法仍为def2svp pbe1pbeTS,但是产物两端一样,IRC也是不对的吗

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发表于 Post on 2025-7-17 14:05:50 | 只看该作者 Only view this author
Danggui 发表于 2025-7-17 13:27
老师,按照论坛上面帖子的经验分享尝试了找了很多的TS,发现之前报错的原因应该是因为过渡态找的结构太离谱 ...

2. Cu-EDTA的这一段IRC曲线看起来还行,没跑到反应物对应的极小点附近是因为maxpoints参数不够大(或者根本就没设所以用了默认的10),在链接的400号博文中ctrl+f搜“获得高质量、完整的IRC曲线”有说明。
3. 我不知道CuOH-H是啥,还是那篇博文搜“怎么IRC走出来的两侧的曲线是相同的”有说明,如果没有把握找到的过渡态对不对的话可以传上来看看。
√546=23.36664289109

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