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[Gaussian/gview] G09势能面扫描问题

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老师好,这是我用g09做柔性势能面扫描的曲线图,通过扫描键长减少距离来实现的,想问下最后出现几个断点是怎么回事?是我的结构不好吗?发现断点前后结构发生了发生扭动,谢谢各位老师的指点。

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扫描曲线

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发表于 Post on 2017-3-27 23:18:08 | 只看该作者 Only view this author
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以往往在被扫描的变量越过某一个点后,其余变量优化的方向就朝着和之前一步完全不同的方向去了,显然能量也会突跃。所以突跃是有物理意义的,不代表不合理,而是应当正确理解其原因。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-28 10:25:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以 ...

谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚性的?还有就是减少键长进行柔性扫描时会出现这样一个能垒,但是增加键长扫描时能量一直升高,没有能垒出现,为什么反过来扫描趋势就不一样了呢?

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发表于 Post on 2017-3-28 10:29:19 | 只看该作者 Only view this author
shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25
谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚 ...


用柔性的。刚性的缺乏化学意义
柔性扫描时候其它变量有滞后效应,观看结构判断
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-28 12:06:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-28 10:29
用柔性的。刚性的缺乏化学意义
柔性扫描时候其它变量有滞后效应,观看结构判断

嗯嗯,老师,那通过改变键长来扫描的话,是增加距离比较合理还是减少距离好呢?还是说都可以的,我看有篇文献中是通过减少距离来扫描的,上图中的曲线,我尝试了一个增加距离来扫描,发现能量一直升高。。

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发表于 Post on 2017-3-28 23:34:21 | 只看该作者 Only view this author
shengyuhu 发表于 2017-3-28 12:06
嗯嗯,老师,那通过改变键长来扫描的话,是增加距离比较合理还是减少距离好呢?还是说都可以的,我看有篇 ...

怎么做看你研究什么,是增长和减小没有哪种一定更合适的说法
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-3-29 12:28:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-28 23:34
怎么做看你研究什么,是增长和减小没有哪种一定更合适的说法

嗯嗯,好的,谢谢老师的耐心解答。

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发表于 Post on 2017-11-22 14:49:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-27 23:18
是柔性扫描常见现象,注意观看断点前后结构,应当有几何结构的突变。
柔性扫描每一步都是限制性优化,所以 ...

sob老师,我在做过渡态结构的柔性扫描,扫描二面角的时候,也遇到了同样的问题,并且断点前后结构确实也有一个较大的扭动,但是断点的那两个点,四个收敛条件又是"yes",我不懂这个是什么原因造成的,所以想请教一下老师,谢谢

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发表于 Post on 2017-11-23 18:48:58 | 只看该作者 Only view this author
shengyuhu 发表于 2017-3-28 10:25
谢谢老师,是的,我查看断点前后结构发生了突变,那老师,我做PES想看扫描前后的能垒,是用柔性扫还是刚 ...

您好,我也遇到了和您同样的问题,我想请问一下,断点前后的结构突变代表着什么呢?有啥物理意义啊?谢谢了

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