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[GROMACS] 求助:关于模拟液体时决定浓度的体积

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老师好,我有一个疑问。在gromacs中模拟溶液,这个决定溶液浓度的体积是模拟盒子的体积?还是由放置的液体分子数目推算出来的溶液的体积?感谢老师解答。

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发表于 Post on 2025-6-21 15:31:50 | 只看该作者 Only view this author
不一定是模拟盒子的体积,比如说nvt研究的包括液相和气相,都是液相就是模拟盒子的体积。“由放置的液体分子数目推算出来的溶液的体积”那得知道密度是多少,密度跟力场参数相关

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发表于 Post on 2025-6-22 08:19:43 | 只看该作者 Only view this author
由液相占据的体积来决定。注意往往这个体积本身有一定任意性,比如气液界面的分界不是精确一刀切的
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