计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 271|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 结构优化出现语法错误报错

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

81

eV
积分
95

Level 2 能力者

老师们,这个输入文件在不加"=recalc"时可以正常跑,但会有虚频,而加上后就会提示input line有语法错误,去掉geom=connectivity仍有同样报错
输入输出文件如下,感谢老师们指点

N(SO3)3- opt4.out

4.25 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

N(SO3)3-.gjf

1.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 8

601

帖子

1

威望

4776

eV
积分
5397

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2025-6-25 13:58:43 | 只看该作者 Only view this author
正确的格式是 opt=(Recalc=3) 或者其它你想要的整数
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

14

帖子

0

威望

81

eV
积分
95

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-25 14:07:25 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-6-25 13:58
正确的格式是 opt=(Recalc=3) 或者其它你想要的整数

谢谢老师 明白了

4103

帖子

4

威望

8861

eV
积分
13044

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2025-6-25 14:14:42 | 只看该作者 Only view this author
离进行合理的计算还有不小的距离,建议您仔细阅读回复,以及回复中提到的博文
(1)文件名 和 文件所在的路径 都不要有空格,你这“N(SO3)3- opt4.out”中间有个空格,“E:\Gussian Result\”路径里也有空格。
(2)geom=conn 和 坐标底下的连接关系,这二者要么同时保留,要么同时删掉,均不影响计算。一般为了简洁起见,建议都删掉。
(3)您需要理解recalc的含义(https://gaussian.com/opt/),这是指对 初始结构计算精确二阶导数,之后每隔N步计算精确二阶导数,此举有利于结构优化更快收敛。因此recalc后面必须跟数字,例如opt(recalc=5)或opt=recalc=5。
(4)建议使用#p,而非#,前者可以输出更多信息,报错时更好分析原因。
(5)当前体系为主族元素构成的 成键不复杂的体系,您使用B3LYP泛函 却没有加色散校正,建议阅读以下两篇博文
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的http://sobereva.com/557
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”http://sobereva.com/413
(6)当前体系负电荷较多,应当考虑是否与目标研究问题中的真实环境相差太远(是否有必要考虑阳离子、溶剂分子等),若仅计算此阴离子体系,基组使用6-311g*不合适,需要使用带弥散函数的基组,建议阅读
谈谈量子化学中基组的选择http://sobereva.com/336

做量子化学计算并不是“跑起来了”、“没报错”就是会做计算了、结果就能发表了,而是要学会做合理的计算、经过长期的学习规避各种坑。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
北大-陶豫 + 5 我很赞同

查看全部评分 View all ratings

自动做多参考态计算的程序MOKIT

14

帖子

0

威望

81

eV
积分
95

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-25 15:42:04 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-6-25 14:14
离进行合理的计算还有不小的距离,建议您仔细阅读回复,以及回复中提到的博文
(1)文件名 和 文件所在的 ...

谢谢老师!

14

帖子

0

威望

81

eV
积分
95

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-26 15:43:13 | 只看该作者 Only view this author
优化成功!记录本人生平第二次优化任务就色散矫正 弥散 极化 recalc全都加上了!
小心的在电脑旁监控了一小时 生怕不收敛
but最后 四个Yes+无虚频!非常开心和感谢老师@zjxitcc @北大-陶豫

202506261530197784..png (29.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

202506261530197784..png

202506261530524722..png (35 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

202506261530524722..png

202506261538211639..png (15.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

202506261538211639..png

202506261539363530..png (71.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

202506261539363530..png

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
北大-陶豫 + 5 赞!

查看全部评分 View all ratings

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 17:18 , Processed in 0.310236 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list