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[NAMD] 体系中某一组分PMF计算如何进行分解，例如求取体系中两组分之间的PMF变化

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abing

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楼主
发表于 Post on 2025-6-26 09:36:51 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
向各位老师请教一下我使用ABF方法分窗口计算了体系中某一组分(Protein)，沿反应坐标的PMF。请教一下各位老师，使用Colvar进行分窗口计算时能否实现将计算得到的PMF分解为多组分之间的PMF，如下图所示：(protein和水，protein和其他组分的PMF)


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