计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 287|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] 关于ORCA几何优化破坏分子结构对称性的问题

[复制链接 Copy URL]

19

帖子

0

威望

69

eV
积分
88

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,

最近在使用ORCA做一些Cu配合物分子(配体仅包含CHON)的几何优化时碰到对称性的问题。我这边首先是用ORCA中的GOAT XTB先进行构象检索,然后将能量最低的构象作为我后续几何优化的初猜,几何优化选择的泛函基组为PEB0-D3BJ/def2-SVP。然后发现我的初猜的构型是比较对称的,但经过几何优化后对称性就变差了。比如初猜中2个C和Cu的间距都相近,但是优化后变成了1个C离得近,另1个离得远。想问下各位老师这类问题的解决方法,或者在orca中有没有可能在优化过程中限制分子构型的对称性。谢谢!

1万

帖子

0

威望

8949

eV
积分
20692

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2025-6-26 10:19:31 | 只看该作者 Only view this author
加usesym关键词即可。但优化收敛后必须着重检查虚频数目,有可能不对称的结构才是真实的、没有虚频的

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +4 收起 理由
Reason
Hitomilpc + 4 谢谢

查看全部评分 View all ratings

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

19

帖子

0

威望

69

eV
积分
88

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-26 13:31:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-26 10:19
加usesym关键词即可。但优化收敛后必须着重检查虚频数目,有可能不对称的结构才是真实的、没有虚频的

谢谢老师,我尝试一下

19

帖子

0

威望

69

eV
积分
88

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-26 16:45:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-26 10:19
加usesym关键词即可。但优化收敛后必须着重检查虚频数目,有可能不对称的结构才是真实的、没有虚频的

老师,我按你的方法使用usesym进行优化,优化过程中是固定了C2点群对称,优化完后确实出现了虚频。想请教下老师,为什么有时候非对称的分子构象稳定性会优于对称结构,感觉有点反直觉。谢谢

1万

帖子

0

威望

8949

eV
积分
20692

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2025-6-26 17:04:51 | 只看该作者 Only view this author
Hitomilpc 发表于 2025-6-26 16:45
老师,我按你的方法使用usesym进行优化,优化过程中是固定了C2点群对称,优化完后确实出现了虚频。想请教 ...

这个是因为二级Jahn-Teller效应。
其实一点都不反直觉,比如氨的C3v结构比D3h结构能量低,水的C2v结构比D∞h结构能量低,环丁二烯的D2h结构比D4h结构能量低,等等。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

19

帖子

0

威望

69

eV
积分
88

Level 2 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-26 17:44:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-6-26 17:04
这个是因为二级Jahn-Teller效应。
其实一点都不反直觉,比如氨的C3v结构比D3h结构能量低,水的C2v结构比 ...

谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 17:18 , Processed in 0.515820 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list