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[波函数分析求助] 求助使用VMD绘制NTO编号问题及开壳层体系下alpha和beta贡献的分析

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楼主
题组所分析的体系为开壳层体系,具体如下:
题主疑惑的问题:1.根据sob老师的 http://sobereva.com/377 一文,题组使用了Multiwfn绘制了NTO图,发现Alpha和Beta的自然跃迁轨道图是相同的(Alpha是从NTO247—248,Beta是从NTO1437—1438,且题组尝试的另一个激发态的NTO也是相同)

                         2.sob老师在 http://sobereva.com/377一文种的  “在轨道观看窗口里分别选25和26,从而看到的alpha NTO25 -> alpha NTO26的跃迁就是对电子激发贡献了54.1%的跃迁。而在轨道观看窗口里分别选141和142,窗口右下角的文本框内容自动就变成了-24和-25,因此这俩轨道对应的是beta NTO24和beta NTO25,前者向后者的跃迁对电子激发贡献了39.0%。” Alpha选择的25和26以及Beta选择的141和142所代表的是MO吗
                         3.开壳层体系中,判断NTO对电子激发的贡献时,Alpha和Beta有不同的贡献值,用当如何考虑二者对电子激发的贡献,是否有评判的“标准”。
附件为上述体系的输入文件,其他文件以百度网盘形式给出:通过网盘分享的文件:states.7z
链接: https://pan.baidu.com/s/1KGs2Ff6sdbuu2OGG5D9OZw?pwd=77p6 提取码: 77p6

tj.gjf

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发表于 Post on 2025-7-10 23:21:40 | 只看该作者 Only view this author
恰当写帖子标题。当前帖子内容和VMD没任何关系,怎么帖子标题成了用VMD绘制NTO?及时修改
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-7-11 01:35:43 | 只看该作者 Only view this author
1 我不知道你说的“相同”是什么意思。用Multiwfn基于你的文件对最低激发态进行NTO分析,明显alpha和beta的NTO不同
The highest 10 eigenvalues of alpha NTO pairs:
    0.003378    0.000343    0.000063    0.000016    0.000008
    0.000008    0.000003    0.000003    0.000002    0.000002
Sum of all alpha eigenvalues:  0.003827

The highest 10 eigenvalues of beta NTO pairs:
    1.111629    0.006133    0.000362    0.000075    0.000059
    0.000005    0.000004    0.000003    0.000002    0.000001
Sum of all beta eigenvalues:  1.118272

2 倘若你载入了Multiwfn导出的记录了NTO波函数文件,显然主功能0里看到的就是NTO,跟MO完全是两码事

3 语义不明
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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