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[新手求助] 计算有机阴离子、阳离子和中性小分子反应活性,弥散函数如何添加?

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楼主
本帖最后由 Yuansq 于 2025-7-11 09:27 编辑

各位老师,我选用Bl3yp-D3(BJ)/6-311G**进行优化,m062x/def2tzvp进行单点计算(在SMD溶剂模拟中),想计算阴离子、阳离子和中性有机表面活性剂的Lumo-Homo gap,静电势,Fukui函数及全局/局部软度,以此对比反应活性。已经认真学习了Sob老师的许多帖子,但是个人过于小白,仍然想咨询以下问题:

1. 是否可以对于阴离子的带负电原子,单独加弥散,具体为Bl3yp-D3(BJ)/6-311+G**;m062x/def2-TZVPD,其他仍然保持不变

2. Lumo-Homo gap对于不同类型的有机分子,比较意义不大,是否会被审稿人批。但也看见不少文章放进去对比
非常感谢,如果求助帖格式或提问不专业之处,恳请原谅,非常感谢大家的指导与帮助

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发表于 Post on 2025-7-11 09:34:13 | 只看该作者 Only view this author
首先,那叫HOMO-LUMO gap
其次,问题不在于能否比较不同分子的HOMO-LUMO gap,而是在于能否从HOMO-LUMO gap推知反应活性,这个需要诸多的前提条件(https://mattermodeling.stackexch ... -and-lumo/7154#7154),如果不能证明这些条件全部成立,就不要用HOMO-LUMO gap说明反应活性
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-11 09:42:43 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-7-11 09:34
首先,那叫HOMO-LUMO gap
其次,问题不在于能否比较不同分子的HOMO-LUMO gap,而是在于能否从HOMO-LUMO ga ...

收到!非常感谢王老师的指正与指导,我才知道有这么严格的条件,那应该是不可以用HOMO-LUMO gap来说明了。
以及想请问您是否可以使用Bl3yp-D3(BJ)/6-311+G**;m062x/def2-TZVPD来计算所有的阴阳离子和分子;还是单独给阴离子的负电原子添加弥散函数,请问这两种方法哪一种应该被优先考虑呢

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发表于 Post on 2025-7-11 10:18:47 | 只看该作者 Only view this author
Yuansq 发表于 2025-7-11 09:42
收到!非常感谢王老师的指正与指导,我才知道有这么严格的条件,那应该是不可以用HOMO-LUMO gap来说明了 ...

某个原子但凡在你要算的一个物种里带显著负电(注意定语“显著”,带-0.2电不叫显著,带-1.0电叫显著,两者的分界线自己把握),就要加弥散函数,即使这个原子在其他物种里带正电。举例:计算乙酸根的电离能,乙酸根的两个氧、乙酸自由基的两个氧都要带弥散,即使后者不带明显负电;但碳和氢不用加弥散。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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